Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIF5AQ12840 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KIF5AQ12840 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KIF5AQ12840 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KIF5AQ12840 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KIF5AQ12840 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KIF5AQ12840 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIF5AQ12840 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KIF5AQ12840 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIF5AQ12840 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIF5AQ12840 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIF5AQ12840 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIF5AQ12840 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KIF5AQ12840 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KIF5AQ12840 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIF5AQ12840 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIF5AQ12840 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIF5AQ12840 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIF5AQ12840 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIF5AQ12840 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIF5AQ12840 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KIF5AQ12840 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KIF5AQ12840 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIF5AQ12840 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIF5AQ12840 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF5AQ12840 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF5AQ12840 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIF5AQ12840 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIF5AQ12840 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIF5AQ12840 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIF5AQ12840 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIF5AQ12840 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIF5AQ12840 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIF5AQ12840 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIF5AQ12840 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIF5AQ12840 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIF5AQ12840 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIF5AQ12840 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KIF5AQ12840 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF5AQ12840 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF5AQ12840 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF5AQ12840 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF5AQ12840 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIF5AQ12840 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIF5AQ12840 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIF5AQ12840 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIF5AQ12840 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIF5AQ12840 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIF5AQ12840 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KIF5AQ12840 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIF5AQ12840 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIF5AQ12840 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIF5AQ12840 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIF5AQ12840 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIF5AQ12840 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIF5AQ12840 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF5AQ12840 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF5AQ12840 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF5AQ12840 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIF5AQ12840 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIF5AQ12840 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KIF5AQ12840 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIF5AQ12840 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIF5AQ12840 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIF5AQ12840 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIF5AQ12840 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIF5AQ12840 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIF5AQ12840 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KIF5AQ12840 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIF5AQ12840 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIF5AQ12840 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIF5AQ12840 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIF5AQ12840 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIF5AQ12840 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIF5AQ12840 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIF5AQ12840 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIF5AQ12840 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIF5AQ12840 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIF5AQ12840 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIF5AQ12840 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIF5AQ12840 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIF5AQ12840 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIF5AQ12840 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIF5AQ12840 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIF5AQ12840 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIF5AQ12840 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIF5AQ12840 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIF5AQ12840 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF5AQ12840 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF5AQ12840 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIF5AQ12840 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIF5AQ12840 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIF5AQ12840 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIF5AQ12840 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIF5AQ12840 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIF5AQ12840 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIF5AQ12840 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIF5AQ12840 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIF5AQ12840 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIF5AQ12840 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
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