Protein–RNA interactions for Protein: Q12756

KIF1A, Kinesin-like protein KIF1A, humanhuman

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1AQ12756 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
KIF1AQ12756 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
KIF1AQ12756 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
KIF1AQ12756 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC38.07■■■■□ 3.68
KIF1AQ12756 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
KIF1AQ12756 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
KIF1AQ12756 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
KIF1AQ12756 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
KIF1AQ12756 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
KIF1AQ12756 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
KIF1AQ12756 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.02■■■■□ 3.68
KIF1AQ12756 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
KIF1AQ12756 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
KIF1AQ12756 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
KIF1AQ12756 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
KIF1AQ12756 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
KIF1AQ12756 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
KIF1AQ12756 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
KIF1AQ12756 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.66
KIF1AQ12756 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
KIF1AQ12756 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
KIF1AQ12756 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
KIF1AQ12756 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
KIF1AQ12756 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
KIF1AQ12756 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
KIF1AQ12756 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
KIF1AQ12756 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
KIF1AQ12756 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
KIF1AQ12756 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
KIF1AQ12756 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
KIF1AQ12756 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
KIF1AQ12756 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
KIF1AQ12756 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
KIF1AQ12756 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.65
KIF1AQ12756 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
KIF1AQ12756 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
KIF1AQ12756 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
KIF1AQ12756 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
KIF1AQ12756 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
KIF1AQ12756 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KIF1AQ12756 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
KIF1AQ12756 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
KIF1AQ12756 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
KIF1AQ12756 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
KIF1AQ12756 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
KIF1AQ12756 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.72■■■■□ 3.63
KIF1AQ12756 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
KIF1AQ12756 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
KIF1AQ12756 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
KIF1AQ12756 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
KIF1AQ12756 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
KIF1AQ12756 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
KIF1AQ12756 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
KIF1AQ12756 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
KIF1AQ12756 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
KIF1AQ12756 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
KIF1AQ12756 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
KIF1AQ12756 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
KIF1AQ12756 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
KIF1AQ12756 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
KIF1AQ12756 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
KIF1AQ12756 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
KIF1AQ12756 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
KIF1AQ12756 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
KIF1AQ12756 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
KIF1AQ12756 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
KIF1AQ12756 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
KIF1AQ12756 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
KIF1AQ12756 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
KIF1AQ12756 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
KIF1AQ12756 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
KIF1AQ12756 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
KIF1AQ12756 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
KIF1AQ12756 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
KIF1AQ12756 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.47■■■■□ 3.59
KIF1AQ12756 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
KIF1AQ12756 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
KIF1AQ12756 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
KIF1AQ12756 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
KIF1AQ12756 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
KIF1AQ12756 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
KIF1AQ12756 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
KIF1AQ12756 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
KIF1AQ12756 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
KIF1AQ12756 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
KIF1AQ12756 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
KIF1AQ12756 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
KIF1AQ12756 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
KIF1AQ12756 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
KIF1AQ12756 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
KIF1AQ12756 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
KIF1AQ12756 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
KIF1AQ12756 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
KIF1AQ12756 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.35■■■■□ 3.57
KIF1AQ12756 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
KIF1AQ12756 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
KIF1AQ12756 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.34■■■■□ 3.57
KIF1AQ12756 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
KIF1AQ12756 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
KIF1AQ12756 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms