Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOXL1Q08397 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOXL1Q08397 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LOXL1Q08397 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LOXL1Q08397 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOXL1Q08397 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOXL1Q08397 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOXL1Q08397 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOXL1Q08397 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOXL1Q08397 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXL1Q08397 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LOXL1Q08397 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOXL1Q08397 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXL1Q08397 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXL1Q08397 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXL1Q08397 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXL1Q08397 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXL1Q08397 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXL1Q08397 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXL1Q08397 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXL1Q08397 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXL1Q08397 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXL1Q08397 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXL1Q08397 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LOXL1Q08397 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LOXL1Q08397 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LOXL1Q08397 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LOXL1Q08397 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LOXL1Q08397 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LOXL1Q08397 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LOXL1Q08397 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LOXL1Q08397 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LOXL1Q08397 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LOXL1Q08397 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LOXL1Q08397 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LOXL1Q08397 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LOXL1Q08397 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LOXL1Q08397 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LOXL1Q08397 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LOXL1Q08397 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LOXL1Q08397 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LOXL1Q08397 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LOXL1Q08397 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LOXL1Q08397 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LOXL1Q08397 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LOXL1Q08397 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LOXL1Q08397 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LOXL1Q08397 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LOXL1Q08397 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LOXL1Q08397 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LOXL1Q08397 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LOXL1Q08397 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LOXL1Q08397 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LOXL1Q08397 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LOXL1Q08397 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LOXL1Q08397 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LOXL1Q08397 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LOXL1Q08397 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LOXL1Q08397 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXL1Q08397 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXL1Q08397 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXL1Q08397 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXL1Q08397 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXL1Q08397 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LOXL1Q08397 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LOXL1Q08397 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LOXL1Q08397 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LOXL1Q08397 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LOXL1Q08397 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LOXL1Q08397 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LOXL1Q08397 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LOXL1Q08397 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LOXL1Q08397 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOXL1Q08397 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LOXL1Q08397 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOXL1Q08397 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LOXL1Q08397 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LOXL1Q08397 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LOXL1Q08397 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LOXL1Q08397 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LOXL1Q08397 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LOXL1Q08397 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LOXL1Q08397 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LOXL1Q08397 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOXL1Q08397 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOXL1Q08397 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LOXL1Q08397 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL1Q08397 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL1Q08397 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXL1Q08397 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXL1Q08397 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXL1Q08397 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXL1Q08397 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LOXL1Q08397 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LOXL1Q08397 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LOXL1Q08397 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LOXL1Q08397 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LOXL1Q08397 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LOXL1Q08397 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LOXL1Q08397 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms