Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
GOLGA3Q08378 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC44.76■■■■■ 4.76
GOLGA3Q08378 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
GOLGA3Q08378 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
GOLGA3Q08378 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
GOLGA3Q08378 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC44.71■■■■■ 4.75
GOLGA3Q08378 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC44.71■■■■■ 4.75
GOLGA3Q08378 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
GOLGA3Q08378 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.73
GOLGA3Q08378 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC44.61■■■■■ 4.73
GOLGA3Q08378 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC44.61■■■■■ 4.73
GOLGA3Q08378 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
GOLGA3Q08378 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
GOLGA3Q08378 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
GOLGA3Q08378 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
GOLGA3Q08378 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
GOLGA3Q08378 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
GOLGA3Q08378 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
GOLGA3Q08378 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
GOLGA3Q08378 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
GOLGA3Q08378 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
GOLGA3Q08378 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
GOLGA3Q08378 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
GOLGA3Q08378 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
GOLGA3Q08378 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
GOLGA3Q08378 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
GOLGA3Q08378 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
GOLGA3Q08378 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
GOLGA3Q08378 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
GOLGA3Q08378 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
GOLGA3Q08378 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.4■■■■■ 4.7
GOLGA3Q08378 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
GOLGA3Q08378 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
GOLGA3Q08378 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
GOLGA3Q08378 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC44.35■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC44.32■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
GOLGA3Q08378 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
GOLGA3Q08378 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
GOLGA3Q08378 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
GOLGA3Q08378 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
GOLGA3Q08378 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
GOLGA3Q08378 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
GOLGA3Q08378 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
GOLGA3Q08378 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.23■■■■■ 4.67
GOLGA3Q08378 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
GOLGA3Q08378 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
GOLGA3Q08378 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
GOLGA3Q08378 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
GOLGA3Q08378 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC44.19■■■■■ 4.66
GOLGA3Q08378 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
GOLGA3Q08378 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
GOLGA3Q08378 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
GOLGA3Q08378 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
GOLGA3Q08378 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
GOLGA3Q08378 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
GOLGA3Q08378 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
GOLGA3Q08378 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
GOLGA3Q08378 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
GOLGA3Q08378 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
GOLGA3Q08378 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
GOLGA3Q08378 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC44.08■■■■■ 4.65
GOLGA3Q08378 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
GOLGA3Q08378 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
GOLGA3Q08378 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
GOLGA3Q08378 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC44.06■■■■■ 4.64
GOLGA3Q08378 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
GOLGA3Q08378 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
GOLGA3Q08378 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
GOLGA3Q08378 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
GOLGA3Q08378 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
GOLGA3Q08378 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
GOLGA3Q08378 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC44■■■■■ 4.63
GOLGA3Q08378 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
GOLGA3Q08378 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
GOLGA3Q08378 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
GOLGA3Q08378 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
GOLGA3Q08378 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
GOLGA3Q08378 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms