Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ACTN3Q08043 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACTN3Q08043 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACTN3Q08043 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACTN3Q08043 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACTN3Q08043 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACTN3Q08043 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACTN3Q08043 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACTN3Q08043 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACTN3Q08043 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACTN3Q08043 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACTN3Q08043 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACTN3Q08043 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACTN3Q08043 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACTN3Q08043 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACTN3Q08043 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACTN3Q08043 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACTN3Q08043 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACTN3Q08043 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACTN3Q08043 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACTN3Q08043 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACTN3Q08043 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ACTN3Q08043 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACTN3Q08043 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACTN3Q08043 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACTN3Q08043 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN3Q08043 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN3Q08043 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN3Q08043 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTN3Q08043 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTN3Q08043 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACTN3Q08043 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACTN3Q08043 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACTN3Q08043 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACTN3Q08043 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACTN3Q08043 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
ACTN3Q08043 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTN3Q08043 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTN3Q08043 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTN3Q08043 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTN3Q08043 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTN3Q08043 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTN3Q08043 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTN3Q08043 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACTN3Q08043 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACTN3Q08043 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACTN3Q08043 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACTN3Q08043 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN3Q08043 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN3Q08043 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN3Q08043 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTN3Q08043 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTN3Q08043 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTN3Q08043 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTN3Q08043 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ACTN3Q08043 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACTN3Q08043 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACTN3Q08043 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACTN3Q08043 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACTN3Q08043 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACTN3Q08043 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACTN3Q08043 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACTN3Q08043 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACTN3Q08043 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACTN3Q08043 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTN3Q08043 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTN3Q08043 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTN3Q08043 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTN3Q08043 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTN3Q08043 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACTN3Q08043 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACTN3Q08043 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTN3Q08043 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTN3Q08043 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTN3Q08043 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTN3Q08043 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTN3Q08043 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACTN3Q08043 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACTN3Q08043 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACTN3Q08043 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACTN3Q08043 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACTN3Q08043 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTN3Q08043 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTN3Q08043 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACTN3Q08043 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACTN3Q08043 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACTN3Q08043 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN3Q08043 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN3Q08043 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN3Q08043 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN3Q08043 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN3Q08043 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACTN3Q08043 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACTN3Q08043 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTN3Q08043 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTN3Q08043 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN3Q08043 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN3Q08043 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN3Q08043 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN3Q08043 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms