Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TNK2Q07912 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNK2Q07912 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNK2Q07912 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNK2Q07912 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNK2Q07912 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNK2Q07912 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNK2Q07912 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNK2Q07912 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNK2Q07912 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNK2Q07912 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TNK2Q07912 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNK2Q07912 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNK2Q07912 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNK2Q07912 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNK2Q07912 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNK2Q07912 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNK2Q07912 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNK2Q07912 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNK2Q07912 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNK2Q07912 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNK2Q07912 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNK2Q07912 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNK2Q07912 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TNK2Q07912 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNK2Q07912 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNK2Q07912 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNK2Q07912 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNK2Q07912 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNK2Q07912 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNK2Q07912 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNK2Q07912 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TNK2Q07912 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNK2Q07912 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TNK2Q07912 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNK2Q07912 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNK2Q07912 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TNK2Q07912 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNK2Q07912 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNK2Q07912 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNK2Q07912 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNK2Q07912 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNK2Q07912 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNK2Q07912 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNK2Q07912 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNK2Q07912 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNK2Q07912 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNK2Q07912 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNK2Q07912 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNK2Q07912 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNK2Q07912 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNK2Q07912 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNK2Q07912 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNK2Q07912 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNK2Q07912 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNK2Q07912 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNK2Q07912 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNK2Q07912 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNK2Q07912 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNK2Q07912 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNK2Q07912 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNK2Q07912 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNK2Q07912 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNK2Q07912 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNK2Q07912 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNK2Q07912 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNK2Q07912 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNK2Q07912 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNK2Q07912 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNK2Q07912 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNK2Q07912 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNK2Q07912 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNK2Q07912 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TNK2Q07912 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNK2Q07912 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNK2Q07912 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNK2Q07912 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNK2Q07912 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms