Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFF3Q07654 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFF3Q07654 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFF3Q07654 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TFF3Q07654 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TFF3Q07654 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFF3Q07654 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFF3Q07654 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFF3Q07654 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFF3Q07654 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFF3Q07654 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFF3Q07654 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TFF3Q07654 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFF3Q07654 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFF3Q07654 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFF3Q07654 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFF3Q07654 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFF3Q07654 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFF3Q07654 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TFF3Q07654 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFF3Q07654 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFF3Q07654 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFF3Q07654 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFF3Q07654 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFF3Q07654 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFF3Q07654 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFF3Q07654 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFF3Q07654 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFF3Q07654 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFF3Q07654 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFF3Q07654 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFF3Q07654 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFF3Q07654 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFF3Q07654 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFF3Q07654 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFF3Q07654 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFF3Q07654 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFF3Q07654 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFF3Q07654 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFF3Q07654 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFF3Q07654 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFF3Q07654 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFF3Q07654 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFF3Q07654 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFF3Q07654 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFF3Q07654 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFF3Q07654 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFF3Q07654 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFF3Q07654 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFF3Q07654 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFF3Q07654 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFF3Q07654 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFF3Q07654 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFF3Q07654 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFF3Q07654 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFF3Q07654 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFF3Q07654 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TFF3Q07654 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFF3Q07654 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFF3Q07654 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFF3Q07654 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFF3Q07654 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFF3Q07654 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFF3Q07654 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFF3Q07654 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFF3Q07654 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFF3Q07654 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFF3Q07654 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFF3Q07654 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFF3Q07654 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFF3Q07654 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFF3Q07654 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFF3Q07654 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFF3Q07654 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFF3Q07654 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFF3Q07654 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TFF3Q07654 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFF3Q07654 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFF3Q07654 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFF3Q07654 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFF3Q07654 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TFF3Q07654 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TFF3Q07654 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TFF3Q07654 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFF3Q07654 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TFF3Q07654 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFF3Q07654 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFF3Q07654 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFF3Q07654 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFF3Q07654 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFF3Q07654 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFF3Q07654 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFF3Q07654 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TFF3Q07654 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFF3Q07654 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFF3Q07654 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFF3Q07654 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFF3Q07654 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TFF3Q07654 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TFF3Q07654 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms