Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK18Q07002 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK18Q07002 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK18Q07002 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK18Q07002 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK18Q07002 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK18Q07002 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK18Q07002 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK18Q07002 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK18Q07002 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK18Q07002 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK18Q07002 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK18Q07002 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK18Q07002 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK18Q07002 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK18Q07002 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CDK18Q07002 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CDK18Q07002 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK18Q07002 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDK18Q07002 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK18Q07002 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDK18Q07002 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK18Q07002 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK18Q07002 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK18Q07002 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK18Q07002 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK18Q07002 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK18Q07002 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK18Q07002 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK18Q07002 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK18Q07002 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK18Q07002 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK18Q07002 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK18Q07002 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK18Q07002 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK18Q07002 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK18Q07002 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK18Q07002 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDK18Q07002 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDK18Q07002 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK18Q07002 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK18Q07002 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK18Q07002 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK18Q07002 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK18Q07002 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK18Q07002 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK18Q07002 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK18Q07002 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK18Q07002 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK18Q07002 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK18Q07002 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK18Q07002 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK18Q07002 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK18Q07002 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK18Q07002 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK18Q07002 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK18Q07002 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK18Q07002 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK18Q07002 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK18Q07002 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK18Q07002 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK18Q07002 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK18Q07002 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK18Q07002 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK18Q07002 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK18Q07002 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK18Q07002 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK18Q07002 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK18Q07002 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK18Q07002 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK18Q07002 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK18Q07002 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK18Q07002 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK18Q07002 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK18Q07002 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK18Q07002 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK18Q07002 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK18Q07002 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK18Q07002 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK18Q07002 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK18Q07002 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK18Q07002 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK18Q07002 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK18Q07002 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK18Q07002 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK18Q07002 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK18Q07002 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK18Q07002 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK18Q07002 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK18Q07002 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK18Q07002 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK18Q07002 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK18Q07002 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK18Q07002 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK18Q07002 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK18Q07002 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK18Q07002 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK18Q07002 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK18Q07002 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK18Q07002 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms