Protein–RNA interactions for Protein: Q06485

ATG33, Autophagy-related protein 33, yeastyeast

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG33Q06485 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.13□□□□□ -1.11
ATG33Q06485 YGR201CYGR201C 678 nt8.13□□□□□ -1.11
ATG33Q06485 AQY2YLL052C 450 nt8.13□□□□□ -1.11
ATG33Q06485 TIM23YNR017W 669 nt8.13□□□□□ -1.11
ATG33Q06485 VPS60YDR486C 690 nt8.12□□□□□ -1.11
ATG33Q06485 BNS1YGR230W 414 nt8.12□□□□□ -1.11
ATG33Q06485 HSL7YBR133C 2484 nt8.11□□□□□ -1.11
ATG33Q06485 CCT4YDL143W 1587 nt8.1□□□□□ -1.11
ATG33Q06485 MGM101YJR144W 810 nt8.1□□□□□ -1.11
ATG33Q06485 ATG17YLR423C 1254 nt8.1□□□□□ -1.11
ATG33Q06485 REG2YBR050C 1017 nt8.1□□□□□ -1.11
ATG33Q06485 AAC3YBR085W 924 nt8.1□□□□□ -1.11
ATG33Q06485 SWC5YBR231C 912 nt8.1□□□□□ -1.11
ATG33Q06485 DUT1YBR252W 444 nt8.09□□□□□ -1.11
ATG33Q06485 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.09□□□□□ -1.11
ATG33Q06485 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.09□□□□□ -1.11
ATG33Q06485 YMR244WYMR244W 1068 nt8.08□□□□□ -1.12
ATG33Q06485 GOR1YNL274C 1053 nt8.08□□□□□ -1.12
ATG33Q06485 AVT6YER119C 1347 nt8.06□□□□□ -1.12
ATG33Q06485 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt8.06□□□□□ -1.12
ATG33Q06485 HEL2YDR266C 1920 nt8.05□□□□□ -1.12
ATG33Q06485 ALG3YBL082C 1377 nt8.05□□□□□ -1.12
ATG33Q06485 YNL165WYNL165W 1221 nt8.04□□□□□ -1.12
ATG33Q06485 YHR131CYHR131C 2553 nt8.03□□□□□ -1.12
ATG33Q06485 HDA1YNL021W 2121 nt8.03□□□□□ -1.12
ATG33Q06485 RTN2YDL204W 1182 nt8.02□□□□□ -1.13
ATG33Q06485 YKL030WYKL030W 606 nt8.02□□□□□ -1.13
ATG33Q06485 ABZ2YMR289W 1125 nt8.02□□□□□ -1.13
ATG33Q06485 YPR064WYPR064W 420 nt8.02□□□□□ -1.13
ATG33Q06485 NDI1YML120C 1542 nt8.02□□□□□ -1.13
ATG33Q06485 GTB1YDR221W 2109 nt8.02□□□□□ -1.13
ATG33Q06485 GDH3YAL062W 1374 nt8.01□□□□□ -1.13
ATG33Q06485 AHT1YHR093W 549 nt8□□□□□ -1.13
ATG33Q06485 SPP1YPL138C 1062 nt7.99□□□□□ -1.13
ATG33Q06485 YHM2YMR241W 945 nt7.96□□□□□ -1.14
ATG33Q06485 TOK1YJL093C 2076 nt7.93□□□□□ -1.14
ATG33Q06485 HMG2YLR450W 3138 nt7.93□□□□□ -1.14
ATG33Q06485 GAL2YLR081W 1725 nt7.93□□□□□ -1.14
ATG33Q06485 SPT20YOL148C 1815 nt7.92□□□□□ -1.14
ATG33Q06485 INA1YLR413W 2028 nt7.92□□□□□ -1.14
ATG33Q06485 YJL211CYJL211C 444 nt7.91□□□□□ -1.14
ATG33Q06485 TAD3YLR316C 969 nt7.91□□□□□ -1.14
ATG33Q06485 HXT10YFL011W 1641 nt7.88□□□□□ -1.15
ATG33Q06485 TPO4YOR273C 1980 nt7.88□□□□□ -1.15
ATG33Q06485 YPL277CYPL277C 1464 nt7.87□□□□□ -1.15
ATG33Q06485 EEB1YPL095C 1371 nt7.87□□□□□ -1.15
ATG33Q06485 HIF1YLL022C 1158 nt7.87□□□□□ -1.15
ATG33Q06485 SWP1YMR149W 861 nt7.87□□□□□ -1.15
ATG33Q06485 PLB1YMR008C 1995 nt7.87□□□□□ -1.15
ATG33Q06485 ALD4YOR374W 1560 nt7.87□□□□□ -1.15
ATG33Q06485 YKR023WYKR023W 1593 nt7.86□□□□□ -1.15
ATG33Q06485 SHM2YLR058C 1410 nt7.86□□□□□ -1.15
ATG33Q06485 PRM5YIL117C 957 nt7.84□□□□□ -1.15
ATG33Q06485 YLR415CYLR415C 339 nt7.84□□□□□ -1.15
ATG33Q06485 RPC82YPR190C 1965 nt7.84□□□□□ -1.15
ATG33Q06485 TIM17YJL143W 477 nt7.82□□□□□ -1.16
ATG33Q06485 MAK32YCR019W 1092 nt7.8□□□□□ -1.16
ATG33Q06485 URA8YJR103W 1737 nt7.8□□□□□ -1.16
ATG33Q06485 YCR102CYCR102C 1107 nt7.79□□□□□ -1.16
ATG33Q06485 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt7.78□□□□□ -1.16
ATG33Q06485 NBP35YGL091C 987 nt7.78□□□□□ -1.16
ATG33Q06485 BDH1YAL060W 1149 nt7.78□□□□□ -1.16
ATG33Q06485 ARP6YLR085C 1317 nt7.78□□□□□ -1.16
ATG33Q06485 DAT1YML113W 747 nt7.77□□□□□ -1.17
ATG33Q06485 RIM8YGL045W 1629 nt7.77□□□□□ -1.17
ATG33Q06485 UGA4YDL210W 1716 nt7.76□□□□□ -1.17
ATG33Q06485 ECM27YJR106W 2178 nt7.76□□□□□ -1.17
ATG33Q06485 FRA1YLL029W 2250 nt7.75□□□□□ -1.17
ATG33Q06485 ZRT3YKL175W 1512 nt7.73□□□□□ -1.17
ATG33Q06485 UTR1YJR049C 1593 nt7.73□□□□□ -1.17
ATG33Q06485 SAM35YHR083W 990 nt7.73□□□□□ -1.17
ATG33Q06485 NIT1YIL164C 600 nt7.73□□□□□ -1.17
ATG33Q06485 PZF1YPR186C 1290 nt7.73□□□□□ -1.17
ATG33Q06485 HUA1YGR268C 597 nt7.72□□□□□ -1.17
ATG33Q06485 SGT2YOR007C 1041 nt7.71□□□□□ -1.18
ATG33Q06485 MUP1YGR055W 1725 nt7.69□□□□□ -1.18
ATG33Q06485 HMT1YBR034C 1047 nt7.69□□□□□ -1.18
ATG33Q06485 VPS62YGR141W 1404 nt7.69□□□□□ -1.18
ATG33Q06485 UBP13YBL067C 2244 nt7.68□□□□□ -1.18
ATG33Q06485 RTG1YOL067C 534 nt7.67□□□□□ -1.18
ATG33Q06485 EHD3YDR036C 1503 nt7.67□□□□□ -1.18
ATG33Q06485 GAP1YKR039W 1809 nt7.66□□□□□ -1.18
ATG33Q06485 NPL6YMR091C 1308 nt7.66□□□□□ -1.18
ATG33Q06485 PAM17YKR065C 594 nt7.65□□□□□ -1.18
ATG33Q06485 YSP3YOR003W 1437 nt7.64□□□□□ -1.19
ATG33Q06485 YGL114WYGL114W 2178 nt7.64□□□□□ -1.19
ATG33Q06485 SNU71YGR013W 1863 nt7.64□□□□□ -1.19
ATG33Q06485 THI72YOR192C 1800 nt7.64□□□□□ -1.19
ATG33Q06485 COX16YJL003W 357 nt7.63□□□□□ -1.19
ATG33Q06485 YJL067WYJL067W 351 nt7.63□□□□□ -1.19
ATG33Q06485 MAE1YKL029C 2010 nt7.62□□□□□ -1.19
ATG33Q06485 NRT1YOR071C 1797 nt7.62□□□□□ -1.19
ATG33Q06485 LSC2YGR244C 1284 nt7.62□□□□□ -1.19
ATG33Q06485 YCR049CYCR049C 447 nt7.61□□□□□ -1.19
ATG33Q06485 SGV1YPR161C 1974 nt7.6□□□□□ -1.19
ATG33Q06485 TIR3YIL011W 810 nt7.6□□□□□ -1.19
ATG33Q06485 YNL024CYNL024C 741 nt7.6□□□□□ -1.19
ATG33Q06485 HOL1YNR055C 1761 nt7.59□□□□□ -1.19
ATG33Q06485 PRO1YDR300C 1287 nt7.59□□□□□ -1.19
ATG33Q06485 PAU7YAR020C 168 nt7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.4 ms