Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSTF1Q05048 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSTF1Q05048 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSTF1Q05048 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSTF1Q05048 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSTF1Q05048 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSTF1Q05048 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSTF1Q05048 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSTF1Q05048 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSTF1Q05048 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSTF1Q05048 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSTF1Q05048 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSTF1Q05048 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSTF1Q05048 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSTF1Q05048 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSTF1Q05048 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CSTF1Q05048 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CSTF1Q05048 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSTF1Q05048 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSTF1Q05048 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSTF1Q05048 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSTF1Q05048 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSTF1Q05048 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSTF1Q05048 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSTF1Q05048 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSTF1Q05048 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSTF1Q05048 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSTF1Q05048 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSTF1Q05048 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CSTF1Q05048 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSTF1Q05048 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSTF1Q05048 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSTF1Q05048 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CSTF1Q05048 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSTF1Q05048 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSTF1Q05048 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSTF1Q05048 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSTF1Q05048 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSTF1Q05048 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSTF1Q05048 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CSTF1Q05048 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSTF1Q05048 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSTF1Q05048 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSTF1Q05048 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSTF1Q05048 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSTF1Q05048 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSTF1Q05048 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSTF1Q05048 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSTF1Q05048 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CSTF1Q05048 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSTF1Q05048 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSTF1Q05048 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSTF1Q05048 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSTF1Q05048 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CSTF1Q05048 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CSTF1Q05048 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CSTF1Q05048 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSTF1Q05048 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSTF1Q05048 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CSTF1Q05048 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CSTF1Q05048 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSTF1Q05048 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSTF1Q05048 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSTF1Q05048 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSTF1Q05048 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSTF1Q05048 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSTF1Q05048 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSTF1Q05048 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSTF1Q05048 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSTF1Q05048 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSTF1Q05048 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSTF1Q05048 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSTF1Q05048 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSTF1Q05048 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSTF1Q05048 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSTF1Q05048 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSTF1Q05048 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSTF1Q05048 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSTF1Q05048 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSTF1Q05048 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CSTF1Q05048 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSTF1Q05048 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSTF1Q05048 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSTF1Q05048 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSTF1Q05048 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSTF1Q05048 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSTF1Q05048 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CSTF1Q05048 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CSTF1Q05048 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CSTF1Q05048 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CSTF1Q05048 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSTF1Q05048 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSTF1Q05048 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CSTF1Q05048 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CSTF1Q05048 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSTF1Q05048 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSTF1Q05048 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CSTF1Q05048 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSTF1Q05048 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSTF1Q05048 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms