Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ATP7AQ04656 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
ATP7AQ04656 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC41.57■■■■■ 4.25
ATP7AQ04656 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
ATP7AQ04656 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
ATP7AQ04656 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ATP7AQ04656 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
ATP7AQ04656 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
ATP7AQ04656 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
ATP7AQ04656 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
ATP7AQ04656 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
ATP7AQ04656 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
ATP7AQ04656 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ATP7AQ04656 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ATP7AQ04656 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ATP7AQ04656 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ATP7AQ04656 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ATP7AQ04656 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
ATP7AQ04656 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
ATP7AQ04656 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ATP7AQ04656 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
ATP7AQ04656 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ATP7AQ04656 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ATP7AQ04656 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
ATP7AQ04656 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
ATP7AQ04656 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
ATP7AQ04656 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
ATP7AQ04656 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ATP7AQ04656 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ATP7AQ04656 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ATP7AQ04656 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ATP7AQ04656 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ATP7AQ04656 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
ATP7AQ04656 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
ATP7AQ04656 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
ATP7AQ04656 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
ATP7AQ04656 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ATP7AQ04656 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ATP7AQ04656 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ATP7AQ04656 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ATP7AQ04656 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ATP7AQ04656 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
ATP7AQ04656 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41.23■■■■■ 4.19
ATP7AQ04656 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
ATP7AQ04656 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
ATP7AQ04656 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ATP7AQ04656 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ATP7AQ04656 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
ATP7AQ04656 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
ATP7AQ04656 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
ATP7AQ04656 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.13■■■■■ 4.18
ATP7AQ04656 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
ATP7AQ04656 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
ATP7AQ04656 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
ATP7AQ04656 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
ATP7AQ04656 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.12■■■■■ 4.17
ATP7AQ04656 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ATP7AQ04656 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ATP7AQ04656 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ATP7AQ04656 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ATP7AQ04656 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.08■■■■■ 4.17
ATP7AQ04656 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
ATP7AQ04656 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
ATP7AQ04656 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
ATP7AQ04656 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
ATP7AQ04656 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
ATP7AQ04656 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
ATP7AQ04656 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
ATP7AQ04656 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
ATP7AQ04656 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
ATP7AQ04656 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
ATP7AQ04656 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
ATP7AQ04656 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
ATP7AQ04656 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
ATP7AQ04656 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
ATP7AQ04656 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ATP7AQ04656 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ATP7AQ04656 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
ATP7AQ04656 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ATP7AQ04656 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ATP7AQ04656 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.14
ATP7AQ04656 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
ATP7AQ04656 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
ATP7AQ04656 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
ATP7AQ04656 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
ATP7AQ04656 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
ATP7AQ04656 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
ATP7AQ04656 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ATP7AQ04656 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
ATP7AQ04656 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ATP7AQ04656 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ATP7AQ04656 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
ATP7AQ04656 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
ATP7AQ04656 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
ATP7AQ04656 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
ATP7AQ04656 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
ATP7AQ04656 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
ATP7AQ04656 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
ATP7AQ04656 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
ATP7AQ04656 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms