Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TFF2Q03403 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TFF2Q03403 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TFF2Q03403 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TFF2Q03403 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TFF2Q03403 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TFF2Q03403 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TFF2Q03403 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TFF2Q03403 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TFF2Q03403 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TFF2Q03403 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TFF2Q03403 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TFF2Q03403 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TFF2Q03403 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TFF2Q03403 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TFF2Q03403 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TFF2Q03403 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TFF2Q03403 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TFF2Q03403 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TFF2Q03403 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TFF2Q03403 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TFF2Q03403 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TFF2Q03403 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TFF2Q03403 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TFF2Q03403 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TFF2Q03403 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TFF2Q03403 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TFF2Q03403 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TFF2Q03403 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TFF2Q03403 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TFF2Q03403 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TFF2Q03403 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TFF2Q03403 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TFF2Q03403 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TFF2Q03403 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TFF2Q03403 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TFF2Q03403 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TFF2Q03403 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TFF2Q03403 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TFF2Q03403 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TFF2Q03403 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TFF2Q03403 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TFF2Q03403 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TFF2Q03403 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TFF2Q03403 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TFF2Q03403 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TFF2Q03403 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TFF2Q03403 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TFF2Q03403 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TFF2Q03403 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TFF2Q03403 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TFF2Q03403 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TFF2Q03403 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TFF2Q03403 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TFF2Q03403 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TFF2Q03403 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TFF2Q03403 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TFF2Q03403 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TFF2Q03403 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TFF2Q03403 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TFF2Q03403 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TFF2Q03403 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TFF2Q03403 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TFF2Q03403 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TFF2Q03403 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TFF2Q03403 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TFF2Q03403 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TFF2Q03403 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TFF2Q03403 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TFF2Q03403 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TFF2Q03403 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TFF2Q03403 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TFF2Q03403 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TFF2Q03403 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TFF2Q03403 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TFF2Q03403 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TFF2Q03403 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFF2Q03403 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TFF2Q03403 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFF2Q03403 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFF2Q03403 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFF2Q03403 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFF2Q03403 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TFF2Q03403 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFF2Q03403 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TFF2Q03403 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFF2Q03403 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TFF2Q03403 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TFF2Q03403 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TFF2Q03403 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFF2Q03403 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TFF2Q03403 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TFF2Q03403 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TFF2Q03403 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TFF2Q03403 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TFF2Q03403 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TFF2Q03403 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TFF2Q03403 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TFF2Q03403 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TFF2Q03403 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms