Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BDH1Q02338 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BDH1Q02338 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BDH1Q02338 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BDH1Q02338 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BDH1Q02338 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BDH1Q02338 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BDH1Q02338 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BDH1Q02338 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BDH1Q02338 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BDH1Q02338 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BDH1Q02338 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BDH1Q02338 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BDH1Q02338 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BDH1Q02338 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BDH1Q02338 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BDH1Q02338 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BDH1Q02338 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BDH1Q02338 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BDH1Q02338 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BDH1Q02338 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BDH1Q02338 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BDH1Q02338 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BDH1Q02338 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BDH1Q02338 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BDH1Q02338 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms