Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BDH1Q02338 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BDH1Q02338 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BDH1Q02338 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BDH1Q02338 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BDH1Q02338 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BDH1Q02338 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BDH1Q02338 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BDH1Q02338 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BDH1Q02338 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BDH1Q02338 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BDH1Q02338 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BDH1Q02338 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BDH1Q02338 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BDH1Q02338 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BDH1Q02338 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BDH1Q02338 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BDH1Q02338 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BDH1Q02338 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BDH1Q02338 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BDH1Q02338 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BDH1Q02338 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BDH1Q02338 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BDH1Q02338 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BDH1Q02338 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BDH1Q02338 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BDH1Q02338 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BDH1Q02338 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BDH1Q02338 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BDH1Q02338 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms