Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SCN7AQ01118 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SCN7AQ01118 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
SCN7AQ01118 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SCN7AQ01118 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SCN7AQ01118 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SCN7AQ01118 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SCN7AQ01118 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SCN7AQ01118 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SCN7AQ01118 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SCN7AQ01118 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SCN7AQ01118 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SCN7AQ01118 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SCN7AQ01118 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SCN7AQ01118 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SCN7AQ01118 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SCN7AQ01118 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SCN7AQ01118 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SCN7AQ01118 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SCN7AQ01118 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SCN7AQ01118 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SCN7AQ01118 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SCN7AQ01118 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SCN7AQ01118 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SCN7AQ01118 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SCN7AQ01118 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SCN7AQ01118 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SCN7AQ01118 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SCN7AQ01118 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SCN7AQ01118 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SCN7AQ01118 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SCN7AQ01118 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SCN7AQ01118 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SCN7AQ01118 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SCN7AQ01118 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SCN7AQ01118 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SCN7AQ01118 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SCN7AQ01118 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SCN7AQ01118 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SCN7AQ01118 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SCN7AQ01118 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SCN7AQ01118 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SCN7AQ01118 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SCN7AQ01118 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SCN7AQ01118 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SCN7AQ01118 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SCN7AQ01118 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SCN7AQ01118 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SCN7AQ01118 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
SCN7AQ01118 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SCN7AQ01118 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCN7AQ01118 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SCN7AQ01118 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SCN7AQ01118 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SCN7AQ01118 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SCN7AQ01118 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SCN7AQ01118 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SCN7AQ01118 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SCN7AQ01118 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SCN7AQ01118 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SCN7AQ01118 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCN7AQ01118 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCN7AQ01118 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCN7AQ01118 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SCN7AQ01118 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SCN7AQ01118 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCN7AQ01118 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCN7AQ01118 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCN7AQ01118 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SCN7AQ01118 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SCN7AQ01118 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SCN7AQ01118 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCN7AQ01118 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCN7AQ01118 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCN7AQ01118 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SCN7AQ01118 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCN7AQ01118 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCN7AQ01118 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCN7AQ01118 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SCN7AQ01118 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SCN7AQ01118 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SCN7AQ01118 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCN7AQ01118 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SCN7AQ01118 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SCN7AQ01118 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SCN7AQ01118 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SCN7AQ01118 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCN7AQ01118 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCN7AQ01118 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
SCN7AQ01118 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SCN7AQ01118 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SCN7AQ01118 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SCN7AQ01118 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SCN7AQ01118 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SCN7AQ01118 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SCN7AQ01118 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SCN7AQ01118 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SCN7AQ01118 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SCN7AQ01118 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SCN7AQ01118 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms