Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRA2BP62995 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRA2BP62995 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRA2BP62995 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRA2BP62995 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRA2BP62995 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRA2BP62995 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRA2BP62995 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRA2BP62995 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRA2BP62995 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRA2BP62995 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRA2BP62995 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRA2BP62995 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRA2BP62995 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRA2BP62995 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRA2BP62995 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRA2BP62995 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRA2BP62995 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRA2BP62995 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRA2BP62995 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRA2BP62995 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRA2BP62995 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRA2BP62995 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRA2BP62995 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRA2BP62995 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRA2BP62995 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRA2BP62995 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRA2BP62995 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRA2BP62995 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRA2BP62995 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRA2BP62995 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRA2BP62995 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRA2BP62995 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRA2BP62995 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRA2BP62995 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRA2BP62995 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRA2BP62995 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRA2BP62995 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRA2BP62995 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRA2BP62995 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRA2BP62995 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRA2BP62995 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRA2BP62995 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRA2BP62995 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRA2BP62995 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRA2BP62995 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRA2BP62995 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRA2BP62995 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRA2BP62995 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRA2BP62995 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRA2BP62995 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRA2BP62995 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRA2BP62995 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRA2BP62995 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRA2BP62995 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRA2BP62995 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRA2BP62995 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRA2BP62995 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRA2BP62995 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRA2BP62995 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRA2BP62995 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRA2BP62995 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRA2BP62995 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRA2BP62995 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRA2BP62995 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRA2BP62995 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRA2BP62995 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRA2BP62995 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRA2BP62995 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRA2BP62995 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRA2BP62995 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRA2BP62995 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRA2BP62995 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRA2BP62995 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRA2BP62995 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRA2BP62995 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRA2BP62995 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRA2BP62995 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRA2BP62995 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRA2BP62995 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRA2BP62995 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRA2BP62995 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRA2BP62995 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRA2BP62995 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRA2BP62995 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRA2BP62995 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRA2BP62995 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRA2BP62995 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRA2BP62995 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRA2BP62995 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRA2BP62995 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRA2BP62995 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRA2BP62995 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRA2BP62995 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRA2BP62995 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRA2BP62995 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRA2BP62995 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRA2BP62995 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRA2BP62995 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRA2BP62995 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms