Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTBP60709 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTBP60709 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTBP60709 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTBP60709 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTBP60709 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTBP60709 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTBP60709 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTBP60709 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTBP60709 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTBP60709 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTBP60709 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTBP60709 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTBP60709 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTBP60709 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTBP60709 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTBP60709 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTBP60709 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTBP60709 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTBP60709 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTBP60709 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTBP60709 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTBP60709 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTBP60709 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTBP60709 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTBP60709 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTBP60709 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTBP60709 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTBP60709 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTBP60709 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTBP60709 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTBP60709 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTBP60709 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTBP60709 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTBP60709 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTBP60709 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTBP60709 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTBP60709 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTBP60709 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTBP60709 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTBP60709 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTBP60709 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTBP60709 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTBP60709 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTBP60709 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTBP60709 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTBP60709 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTBP60709 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTBP60709 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTBP60709 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTBP60709 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTBP60709 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTBP60709 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTBP60709 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTBP60709 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTBP60709 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTBP60709 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTBP60709 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTBP60709 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTBP60709 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTBP60709 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTBP60709 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTBP60709 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTBP60709 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTBP60709 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTBP60709 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTBP60709 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTBP60709 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTBP60709 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTBP60709 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTBP60709 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTBP60709 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTBP60709 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTBP60709 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTBP60709 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTBP60709 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTBP60709 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTBP60709 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTBP60709 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTBP60709 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTBP60709 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTBP60709 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTBP60709 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTBP60709 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTBP60709 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTBP60709 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTBP60709 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTBP60709 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTBP60709 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTBP60709 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTBP60709 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTBP60709 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTBP60709 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTBP60709 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTBP60709 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTBP60709 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTBP60709 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTBP60709 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTBP60709 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTBP60709 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms