Protein–RNA interactions for Protein: P60331

KRTAP10-1, Keratin-associated protein 10-1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-1P60331 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRTAP10-1P60331 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRTAP10-1P60331 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRTAP10-1P60331 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRTAP10-1P60331 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRTAP10-1P60331 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRTAP10-1P60331 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRTAP10-1P60331 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRTAP10-1P60331 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRTAP10-1P60331 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRTAP10-1P60331 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRTAP10-1P60331 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRTAP10-1P60331 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRTAP10-1P60331 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRTAP10-1P60331 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRTAP10-1P60331 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRTAP10-1P60331 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRTAP10-1P60331 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRTAP10-1P60331 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRTAP10-1P60331 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRTAP10-1P60331 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRTAP10-1P60331 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRTAP10-1P60331 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRTAP10-1P60331 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRTAP10-1P60331 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRTAP10-1P60331 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KRTAP10-1P60331 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRTAP10-1P60331 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRTAP10-1P60331 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP10-1P60331 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP10-1P60331 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP10-1P60331 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP10-1P60331 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP10-1P60331 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP10-1P60331 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP10-1P60331 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP10-1P60331 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP10-1P60331 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRTAP10-1P60331 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRTAP10-1P60331 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRTAP10-1P60331 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP10-1P60331 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP10-1P60331 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP10-1P60331 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP10-1P60331 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP10-1P60331 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP10-1P60331 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP10-1P60331 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP10-1P60331 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRTAP10-1P60331 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRTAP10-1P60331 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KRTAP10-1P60331 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRTAP10-1P60331 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRTAP10-1P60331 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRTAP10-1P60331 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms