Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNX16P57768 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNX16P57768 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SNX16P57768 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNX16P57768 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNX16P57768 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNX16P57768 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX16P57768 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNX16P57768 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SNX16P57768 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNX16P57768 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNX16P57768 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SNX16P57768 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNX16P57768 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNX16P57768 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNX16P57768 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNX16P57768 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX16P57768 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX16P57768 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX16P57768 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX16P57768 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNX16P57768 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNX16P57768 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNX16P57768 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNX16P57768 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX16P57768 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX16P57768 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX16P57768 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX16P57768 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX16P57768 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX16P57768 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX16P57768 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX16P57768 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNX16P57768 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNX16P57768 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNX16P57768 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNX16P57768 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX16P57768 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX16P57768 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX16P57768 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX16P57768 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX16P57768 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX16P57768 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX16P57768 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX16P57768 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX16P57768 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX16P57768 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX16P57768 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX16P57768 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX16P57768 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX16P57768 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX16P57768 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX16P57768 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX16P57768 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX16P57768 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX16P57768 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX16P57768 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX16P57768 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX16P57768 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX16P57768 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX16P57768 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX16P57768 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX16P57768 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX16P57768 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX16P57768 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX16P57768 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX16P57768 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX16P57768 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX16P57768 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX16P57768 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX16P57768 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SNX16P57768 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNX16P57768 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNX16P57768 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNX16P57768 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNX16P57768 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX16P57768 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX16P57768 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX16P57768 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX16P57768 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX16P57768 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX16P57768 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX16P57768 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX16P57768 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX16P57768 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX16P57768 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX16P57768 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX16P57768 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNX16P57768 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNX16P57768 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX16P57768 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX16P57768 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX16P57768 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX16P57768 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX16P57768 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX16P57768 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX16P57768 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX16P57768 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX16P57768 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX16P57768 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms