Protein–RNA interactions for Protein: P56851

EDDM3B, Epididymal secretory protein E3-beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDDM3BP56851 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDDM3BP56851 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDDM3BP56851 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDDM3BP56851 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDDM3BP56851 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDDM3BP56851 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDDM3BP56851 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDDM3BP56851 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDDM3BP56851 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDDM3BP56851 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDDM3BP56851 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDDM3BP56851 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDDM3BP56851 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDDM3BP56851 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDDM3BP56851 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDDM3BP56851 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDDM3BP56851 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDDM3BP56851 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDDM3BP56851 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EDDM3BP56851 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDDM3BP56851 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDDM3BP56851 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDDM3BP56851 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDDM3BP56851 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDDM3BP56851 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EDDM3BP56851 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EDDM3BP56851 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDDM3BP56851 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDDM3BP56851 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDDM3BP56851 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDDM3BP56851 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDDM3BP56851 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDDM3BP56851 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDDM3BP56851 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDDM3BP56851 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDDM3BP56851 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDDM3BP56851 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDDM3BP56851 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDDM3BP56851 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDDM3BP56851 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDDM3BP56851 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDDM3BP56851 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDDM3BP56851 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDDM3BP56851 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDDM3BP56851 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDDM3BP56851 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDDM3BP56851 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDDM3BP56851 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDDM3BP56851 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EDDM3BP56851 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDDM3BP56851 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDDM3BP56851 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDDM3BP56851 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDDM3BP56851 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDDM3BP56851 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDDM3BP56851 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EDDM3BP56851 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDDM3BP56851 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDDM3BP56851 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDDM3BP56851 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDDM3BP56851 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDDM3BP56851 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDDM3BP56851 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDDM3BP56851 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EDDM3BP56851 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDDM3BP56851 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDDM3BP56851 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDDM3BP56851 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDDM3BP56851 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDDM3BP56851 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDDM3BP56851 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDDM3BP56851 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDDM3BP56851 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EDDM3BP56851 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDDM3BP56851 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDDM3BP56851 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDDM3BP56851 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDDM3BP56851 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDDM3BP56851 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDDM3BP56851 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDDM3BP56851 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDDM3BP56851 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDDM3BP56851 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDDM3BP56851 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDDM3BP56851 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDDM3BP56851 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDDM3BP56851 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDDM3BP56851 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDDM3BP56851 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDDM3BP56851 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDDM3BP56851 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDDM3BP56851 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDDM3BP56851 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDDM3BP56851 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDDM3BP56851 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDDM3BP56851 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDDM3BP56851 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EDDM3BP56851 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDDM3BP56851 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDDM3BP56851 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms