Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLE2P56282 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLE2P56282 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLE2P56282 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLE2P56282 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLE2P56282 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLE2P56282 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLE2P56282 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLE2P56282 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLE2P56282 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLE2P56282 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLE2P56282 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLE2P56282 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLE2P56282 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLE2P56282 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLE2P56282 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLE2P56282 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLE2P56282 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLE2P56282 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLE2P56282 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLE2P56282 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLE2P56282 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLE2P56282 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLE2P56282 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLE2P56282 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLE2P56282 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLE2P56282 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLE2P56282 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLE2P56282 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLE2P56282 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLE2P56282 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLE2P56282 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLE2P56282 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLE2P56282 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLE2P56282 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLE2P56282 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLE2P56282 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLE2P56282 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLE2P56282 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLE2P56282 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLE2P56282 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLE2P56282 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLE2P56282 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLE2P56282 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLE2P56282 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLE2P56282 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLE2P56282 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLE2P56282 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLE2P56282 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLE2P56282 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLE2P56282 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLE2P56282 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLE2P56282 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
POLE2P56282 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
POLE2P56282 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLE2P56282 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLE2P56282 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLE2P56282 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLE2P56282 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLE2P56282 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
POLE2P56282 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLE2P56282 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLE2P56282 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLE2P56282 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLE2P56282 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLE2P56282 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLE2P56282 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLE2P56282 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLE2P56282 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLE2P56282 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLE2P56282 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLE2P56282 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLE2P56282 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLE2P56282 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLE2P56282 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLE2P56282 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLE2P56282 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLE2P56282 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLE2P56282 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLE2P56282 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLE2P56282 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLE2P56282 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLE2P56282 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
POLE2P56282 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLE2P56282 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLE2P56282 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLE2P56282 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLE2P56282 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLE2P56282 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLE2P56282 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLE2P56282 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLE2P56282 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLE2P56282 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLE2P56282 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
POLE2P56282 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLE2P56282 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLE2P56282 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLE2P56282 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLE2P56282 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLE2P56282 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms