Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SH3BGRP55822 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3BGRP55822 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3BGRP55822 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3BGRP55822 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3BGRP55822 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3BGRP55822 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3BGRP55822 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3BGRP55822 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3BGRP55822 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3BGRP55822 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3BGRP55822 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3BGRP55822 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3BGRP55822 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3BGRP55822 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3BGRP55822 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3BGRP55822 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SH3BGRP55822 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BGRP55822 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BGRP55822 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BGRP55822 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BGRP55822 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BGRP55822 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3BGRP55822 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3BGRP55822 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3BGRP55822 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3BGRP55822 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3BGRP55822 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3BGRP55822 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3BGRP55822 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3BGRP55822 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3BGRP55822 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3BGRP55822 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3BGRP55822 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3BGRP55822 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3BGRP55822 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3BGRP55822 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3BGRP55822 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3BGRP55822 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3BGRP55822 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3BGRP55822 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3BGRP55822 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3BGRP55822 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3BGRP55822 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3BGRP55822 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3BGRP55822 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3BGRP55822 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3BGRP55822 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3BGRP55822 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3BGRP55822 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3BGRP55822 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3BGRP55822 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3BGRP55822 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3BGRP55822 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3BGRP55822 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3BGRP55822 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3BGRP55822 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3BGRP55822 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms