Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP6P55212 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP6P55212 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP6P55212 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP6P55212 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP6P55212 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP6P55212 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP6P55212 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP6P55212 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP6P55212 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP6P55212 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP6P55212 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP6P55212 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP6P55212 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP6P55212 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP6P55212 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP6P55212 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP6P55212 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP6P55212 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP6P55212 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP6P55212 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP6P55212 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP6P55212 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP6P55212 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP6P55212 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP6P55212 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP6P55212 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP6P55212 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP6P55212 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP6P55212 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP6P55212 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CASP6P55212 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CASP6P55212 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP6P55212 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP6P55212 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP6P55212 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP6P55212 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP6P55212 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP6P55212 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP6P55212 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP6P55212 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP6P55212 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP6P55212 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP6P55212 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP6P55212 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP6P55212 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP6P55212 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP6P55212 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP6P55212 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP6P55212 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP6P55212 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP6P55212 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP6P55212 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP6P55212 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP6P55212 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP6P55212 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP6P55212 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP6P55212 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP6P55212 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP6P55212 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP6P55212 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP6P55212 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP6P55212 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP6P55212 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP6P55212 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP6P55212 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP6P55212 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP6P55212 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP6P55212 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP6P55212 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP6P55212 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP6P55212 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP6P55212 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP6P55212 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP6P55212 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP6P55212 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP6P55212 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP6P55212 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP6P55212 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP6P55212 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP6P55212 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP6P55212 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP6P55212 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP6P55212 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP6P55212 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP6P55212 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP6P55212 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP6P55212 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP6P55212 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP6P55212 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP6P55212 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP6P55212 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP6P55212 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP6P55212 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP6P55212 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP6P55212 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP6P55212 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP6P55212 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP6P55212 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP6P55212 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms