Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC16A1P53985 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC16A1P53985 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC16A1P53985 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC16A1P53985 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC16A1P53985 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC16A1P53985 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC16A1P53985 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC16A1P53985 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC16A1P53985 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC16A1P53985 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC16A1P53985 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC16A1P53985 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC16A1P53985 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC16A1P53985 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC16A1P53985 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC16A1P53985 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC16A1P53985 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC16A1P53985 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC16A1P53985 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC16A1P53985 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC16A1P53985 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC16A1P53985 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC16A1P53985 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC16A1P53985 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC16A1P53985 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC16A1P53985 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC16A1P53985 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC16A1P53985 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC16A1P53985 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC16A1P53985 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC16A1P53985 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC16A1P53985 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC16A1P53985 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC16A1P53985 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC16A1P53985 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC16A1P53985 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC16A1P53985 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC16A1P53985 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC16A1P53985 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC16A1P53985 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC16A1P53985 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC16A1P53985 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC16A1P53985 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC16A1P53985 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC16A1P53985 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC16A1P53985 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC16A1P53985 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC16A1P53985 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC16A1P53985 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC16A1P53985 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC16A1P53985 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC16A1P53985 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC16A1P53985 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC16A1P53985 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC16A1P53985 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC16A1P53985 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC16A1P53985 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC16A1P53985 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC16A1P53985 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC16A1P53985 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC16A1P53985 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC16A1P53985 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC16A1P53985 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC16A1P53985 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC16A1P53985 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC16A1P53985 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC16A1P53985 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC16A1P53985 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC16A1P53985 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC16A1P53985 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC16A1P53985 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC16A1P53985 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC16A1P53985 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC16A1P53985 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC16A1P53985 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC16A1P53985 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC16A1P53985 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC16A1P53985 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC16A1P53985 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC16A1P53985 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC16A1P53985 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC16A1P53985 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC16A1P53985 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC16A1P53985 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC16A1P53985 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC16A1P53985 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC16A1P53985 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC16A1P53985 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC16A1P53985 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC16A1P53985 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC16A1P53985 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC16A1P53985 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC16A1P53985 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC16A1P53985 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC16A1P53985 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC16A1P53985 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC16A1P53985 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC16A1P53985 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC16A1P53985 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms