Protein–RNA interactions for Protein: P51671

CCL11, Eotaxin, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL11P51671 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL11P51671 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL11P51671 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCL11P51671 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCL11P51671 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL11P51671 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL11P51671 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL11P51671 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL11P51671 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCL11P51671 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCL11P51671 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCL11P51671 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCL11P51671 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCL11P51671 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL11P51671 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL11P51671 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL11P51671 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL11P51671 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL11P51671 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL11P51671 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL11P51671 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL11P51671 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL11P51671 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL11P51671 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL11P51671 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL11P51671 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL11P51671 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL11P51671 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCL11P51671 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCL11P51671 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCL11P51671 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCL11P51671 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCL11P51671 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCL11P51671 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCL11P51671 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCL11P51671 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCL11P51671 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCL11P51671 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCL11P51671 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCL11P51671 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCL11P51671 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCL11P51671 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL11P51671 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCL11P51671 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCL11P51671 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCL11P51671 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCL11P51671 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL11P51671 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL11P51671 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCL11P51671 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCL11P51671 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCL11P51671 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCL11P51671 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCL11P51671 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCL11P51671 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCL11P51671 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCL11P51671 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCL11P51671 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCL11P51671 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL11P51671 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCL11P51671 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL11P51671 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL11P51671 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL11P51671 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL11P51671 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL11P51671 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL11P51671 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL11P51671 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL11P51671 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL11P51671 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL11P51671 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL11P51671 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL11P51671 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL11P51671 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL11P51671 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCL11P51671 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CCL11P51671 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCL11P51671 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCL11P51671 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL11P51671 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL11P51671 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCL11P51671 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCL11P51671 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCL11P51671 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL11P51671 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL11P51671 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCL11P51671 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCL11P51671 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCL11P51671 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCL11P51671 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL11P51671 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL11P51671 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL11P51671 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL11P51671 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCL11P51671 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL11P51671 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL11P51671 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL11P51671 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL11P51671 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL11P51671 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms