Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB3P49720 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB3P49720 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB3P49720 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB3P49720 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB3P49720 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB3P49720 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB3P49720 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB3P49720 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB3P49720 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB3P49720 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB3P49720 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB3P49720 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB3P49720 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB3P49720 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB3P49720 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB3P49720 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB3P49720 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB3P49720 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB3P49720 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB3P49720 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB3P49720 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB3P49720 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB3P49720 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB3P49720 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB3P49720 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB3P49720 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB3P49720 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB3P49720 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB3P49720 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB3P49720 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB3P49720 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB3P49720 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB3P49720 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB3P49720 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB3P49720 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB3P49720 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB3P49720 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB3P49720 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB3P49720 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB3P49720 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMB3P49720 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMB3P49720 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB3P49720 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB3P49720 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB3P49720 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB3P49720 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB3P49720 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB3P49720 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB3P49720 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB3P49720 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB3P49720 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB3P49720 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB3P49720 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB3P49720 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB3P49720 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB3P49720 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB3P49720 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB3P49720 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB3P49720 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB3P49720 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB3P49720 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB3P49720 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB3P49720 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB3P49720 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB3P49720 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB3P49720 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB3P49720 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB3P49720 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB3P49720 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB3P49720 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB3P49720 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB3P49720 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB3P49720 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB3P49720 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB3P49720 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB3P49720 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB3P49720 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB3P49720 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms