Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PXNP49023 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PXNP49023 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PXNP49023 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PXNP49023 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PXNP49023 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PXNP49023 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PXNP49023 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PXNP49023 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PXNP49023 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PXNP49023 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PXNP49023 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PXNP49023 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PXNP49023 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PXNP49023 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PXNP49023 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PXNP49023 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PXNP49023 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PXNP49023 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PXNP49023 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PXNP49023 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PXNP49023 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PXNP49023 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PXNP49023 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PXNP49023 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PXNP49023 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PXNP49023 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PXNP49023 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PXNP49023 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PXNP49023 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PXNP49023 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PXNP49023 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PXNP49023 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PXNP49023 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PXNP49023 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PXNP49023 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PXNP49023 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PXNP49023 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PXNP49023 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PXNP49023 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PXNP49023 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PXNP49023 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PXNP49023 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PXNP49023 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PXNP49023 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PXNP49023 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PXNP49023 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PXNP49023 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PXNP49023 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PXNP49023 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PXNP49023 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PXNP49023 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PXNP49023 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PXNP49023 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PXNP49023 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PXNP49023 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PXNP49023 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PXNP49023 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PXNP49023 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PXNP49023 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PXNP49023 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PXNP49023 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PXNP49023 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PXNP49023 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PXNP49023 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PXNP49023 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PXNP49023 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PXNP49023 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PXNP49023 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PXNP49023 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PXNP49023 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PXNP49023 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PXNP49023 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PXNP49023 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PXNP49023 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PXNP49023 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PXNP49023 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PXNP49023 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PXNP49023 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PXNP49023 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PXNP49023 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PXNP49023 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PXNP49023 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PXNP49023 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PXNP49023 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PXNP49023 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PXNP49023 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PXNP49023 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PXNP49023 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PXNP49023 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PXNP49023 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PXNP49023 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PXNP49023 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PXNP49023 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PXNP49023 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PXNP49023 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PXNP49023 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PXNP49023 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PXNP49023 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PXNP49023 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms