Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCT5P48643 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCT5P48643 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCT5P48643 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCT5P48643 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCT5P48643 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCT5P48643 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCT5P48643 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCT5P48643 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT5P48643 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT5P48643 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT5P48643 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT5P48643 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT5P48643 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT5P48643 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCT5P48643 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCT5P48643 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCT5P48643 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCT5P48643 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCT5P48643 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCT5P48643 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCT5P48643 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CCT5P48643 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCT5P48643 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCT5P48643 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCT5P48643 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCT5P48643 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCT5P48643 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCT5P48643 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCT5P48643 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCT5P48643 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCT5P48643 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCT5P48643 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCT5P48643 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCT5P48643 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CCT5P48643 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCT5P48643 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT5P48643 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT5P48643 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT5P48643 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT5P48643 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT5P48643 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT5P48643 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT5P48643 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT5P48643 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT5P48643 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT5P48643 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCT5P48643 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCT5P48643 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCT5P48643 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCT5P48643 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCT5P48643 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCT5P48643 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCT5P48643 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCT5P48643 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCT5P48643 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCT5P48643 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCT5P48643 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCT5P48643 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCT5P48643 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCT5P48643 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCT5P48643 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCT5P48643 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCT5P48643 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCT5P48643 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCT5P48643 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCT5P48643 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCT5P48643 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCT5P48643 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCT5P48643 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCT5P48643 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCT5P48643 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCT5P48643 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCT5P48643 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCT5P48643 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCT5P48643 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCT5P48643 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCT5P48643 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCT5P48643 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCT5P48643 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCT5P48643 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCT5P48643 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCT5P48643 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCT5P48643 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCT5P48643 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCT5P48643 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCT5P48643 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCT5P48643 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCT5P48643 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCT5P48643 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCT5P48643 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCT5P48643 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCT5P48643 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCT5P48643 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCT5P48643 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCT5P48643 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCT5P48643 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCT5P48643 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCT5P48643 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCT5P48643 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms