Protein–RNA interactions for Protein: P47872

SCTR, Secretin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCTRP47872 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCTRP47872 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCTRP47872 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCTRP47872 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCTRP47872 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCTRP47872 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCTRP47872 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCTRP47872 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCTRP47872 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCTRP47872 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCTRP47872 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCTRP47872 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCTRP47872 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCTRP47872 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCTRP47872 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCTRP47872 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCTRP47872 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCTRP47872 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCTRP47872 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCTRP47872 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCTRP47872 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCTRP47872 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCTRP47872 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCTRP47872 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCTRP47872 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCTRP47872 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCTRP47872 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCTRP47872 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCTRP47872 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCTRP47872 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCTRP47872 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCTRP47872 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCTRP47872 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCTRP47872 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SCTRP47872 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCTRP47872 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCTRP47872 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCTRP47872 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCTRP47872 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCTRP47872 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCTRP47872 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCTRP47872 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCTRP47872 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCTRP47872 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCTRP47872 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCTRP47872 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCTRP47872 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCTRP47872 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCTRP47872 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCTRP47872 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCTRP47872 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCTRP47872 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCTRP47872 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCTRP47872 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCTRP47872 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCTRP47872 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCTRP47872 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCTRP47872 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCTRP47872 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCTRP47872 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SCTRP47872 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCTRP47872 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCTRP47872 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCTRP47872 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCTRP47872 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCTRP47872 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCTRP47872 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCTRP47872 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCTRP47872 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCTRP47872 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCTRP47872 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCTRP47872 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCTRP47872 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCTRP47872 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCTRP47872 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCTRP47872 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SCTRP47872 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCTRP47872 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCTRP47872 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCTRP47872 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCTRP47872 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCTRP47872 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCTRP47872 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCTRP47872 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCTRP47872 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCTRP47872 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCTRP47872 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCTRP47872 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCTRP47872 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SCTRP47872 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCTRP47872 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCTRP47872 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCTRP47872 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCTRP47872 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SCTRP47872 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCTRP47872 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCTRP47872 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCTRP47872 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCTRP47872 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCTRP47872 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms