Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CSN1S1P47710 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSN1S1P47710 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSN1S1P47710 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSN1S1P47710 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSN1S1P47710 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSN1S1P47710 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CSN1S1P47710 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSN1S1P47710 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSN1S1P47710 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSN1S1P47710 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSN1S1P47710 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSN1S1P47710 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CSN1S1P47710 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSN1S1P47710 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSN1S1P47710 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSN1S1P47710 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSN1S1P47710 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSN1S1P47710 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSN1S1P47710 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CSN1S1P47710 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CSN1S1P47710 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSN1S1P47710 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSN1S1P47710 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSN1S1P47710 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSN1S1P47710 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSN1S1P47710 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSN1S1P47710 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSN1S1P47710 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSN1S1P47710 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSN1S1P47710 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSN1S1P47710 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSN1S1P47710 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSN1S1P47710 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSN1S1P47710 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSN1S1P47710 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSN1S1P47710 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSN1S1P47710 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CSN1S1P47710 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSN1S1P47710 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSN1S1P47710 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSN1S1P47710 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSN1S1P47710 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSN1S1P47710 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSN1S1P47710 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSN1S1P47710 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSN1S1P47710 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSN1S1P47710 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSN1S1P47710 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSN1S1P47710 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSN1S1P47710 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSN1S1P47710 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSN1S1P47710 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSN1S1P47710 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSN1S1P47710 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSN1S1P47710 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSN1S1P47710 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSN1S1P47710 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSN1S1P47710 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSN1S1P47710 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSN1S1P47710 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSN1S1P47710 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSN1S1P47710 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSN1S1P47710 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSN1S1P47710 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSN1S1P47710 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSN1S1P47710 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSN1S1P47710 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSN1S1P47710 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSN1S1P47710 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSN1S1P47710 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSN1S1P47710 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSN1S1P47710 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSN1S1P47710 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSN1S1P47710 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSN1S1P47710 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSN1S1P47710 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSN1S1P47710 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSN1S1P47710 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSN1S1P47710 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSN1S1P47710 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSN1S1P47710 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSN1S1P47710 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSN1S1P47710 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSN1S1P47710 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSN1S1P47710 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSN1S1P47710 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSN1S1P47710 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSN1S1P47710 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSN1S1P47710 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSN1S1P47710 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSN1S1P47710 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSN1S1P47710 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSN1S1P47710 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSN1S1P47710 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSN1S1P47710 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSN1S1P47710 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSN1S1P47710 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSN1S1P47710 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSN1S1P47710 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms