Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MKI67P46013 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MKI67P46013 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MKI67P46013 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MKI67P46013 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MKI67P46013 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MKI67P46013 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
MKI67P46013 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
MKI67P46013 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MKI67P46013 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MKI67P46013 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
MKI67P46013 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
MKI67P46013 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MKI67P46013 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
MKI67P46013 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
MKI67P46013 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MKI67P46013 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MKI67P46013 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
MKI67P46013 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
MKI67P46013 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MKI67P46013 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
MKI67P46013 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MKI67P46013 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
MKI67P46013 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
MKI67P46013 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
MKI67P46013 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
MKI67P46013 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MKI67P46013 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MKI67P46013 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
MKI67P46013 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MKI67P46013 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MKI67P46013 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
MKI67P46013 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
MKI67P46013 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MKI67P46013 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MKI67P46013 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
MKI67P46013 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MKI67P46013 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MKI67P46013 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MKI67P46013 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MKI67P46013 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
MKI67P46013 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
MKI67P46013 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MKI67P46013 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MKI67P46013 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MKI67P46013 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MKI67P46013 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MKI67P46013 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MKI67P46013 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
MKI67P46013 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
MKI67P46013 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MKI67P46013 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
MKI67P46013 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
MKI67P46013 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
MKI67P46013 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MKI67P46013 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MKI67P46013 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MKI67P46013 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MKI67P46013 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MKI67P46013 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MKI67P46013 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MKI67P46013 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MKI67P46013 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MKI67P46013 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MKI67P46013 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
MKI67P46013 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
MKI67P46013 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
MKI67P46013 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
MKI67P46013 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MKI67P46013 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
MKI67P46013 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
MKI67P46013 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MKI67P46013 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MKI67P46013 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
MKI67P46013 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
MKI67P46013 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
MKI67P46013 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MKI67P46013 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
MKI67P46013 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
MKI67P46013 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MKI67P46013 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MKI67P46013 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MKI67P46013 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
MKI67P46013 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MKI67P46013 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MKI67P46013 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
MKI67P46013 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MKI67P46013 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.49
MKI67P46013 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
MKI67P46013 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MKI67P46013 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MKI67P46013 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MKI67P46013 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MKI67P46013 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MKI67P46013 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
MKI67P46013 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MKI67P46013 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MKI67P46013 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
MKI67P46013 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
MKI67P46013 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms