Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL35P42766 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL35P42766 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL35P42766 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL35P42766 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL35P42766 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL35P42766 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL35P42766 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL35P42766 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL35P42766 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL35P42766 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL35P42766 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL35P42766 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL35P42766 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL35P42766 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL35P42766 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL35P42766 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL35P42766 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL35P42766 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL35P42766 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL35P42766 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL35P42766 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL35P42766 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL35P42766 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL35P42766 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL35P42766 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL35P42766 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL35P42766 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL35P42766 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL35P42766 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL35P42766 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL35P42766 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL35P42766 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL35P42766 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL35P42766 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL35P42766 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL35P42766 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL35P42766 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL35P42766 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL35P42766 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL35P42766 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL35P42766 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL35P42766 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL35P42766 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL35P42766 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL35P42766 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL35P42766 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL35P42766 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL35P42766 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL35P42766 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL35P42766 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL35P42766 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL35P42766 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL35P42766 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL35P42766 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL35P42766 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL35P42766 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL35P42766 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL35P42766 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL35P42766 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL35P42766 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL35P42766 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL35P42766 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL35P42766 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL35P42766 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL35P42766 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL35P42766 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL35P42766 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL35P42766 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL35P42766 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL35P42766 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL35P42766 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL35P42766 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL35P42766 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL35P42766 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL35P42766 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL35P42766 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL35P42766 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL35P42766 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL35P42766 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL35P42766 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL35P42766 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL35P42766 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL35P42766 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL35P42766 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL35P42766 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL35P42766 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL35P42766 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL35P42766 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL35P42766 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL35P42766 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL35P42766 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL35P42766 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL35P42766 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL35P42766 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL35P42766 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL35P42766 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL35P42766 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL35P42766 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL35P42766 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms