Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GARSP41250 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GARSP41250 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GARSP41250 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GARSP41250 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GARSP41250 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GARSP41250 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GARSP41250 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GARSP41250 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GARSP41250 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GARSP41250 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GARSP41250 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GARSP41250 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GARSP41250 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GARSP41250 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
GARSP41250 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GARSP41250 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GARSP41250 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GARSP41250 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GARSP41250 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GARSP41250 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GARSP41250 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GARSP41250 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GARSP41250 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GARSP41250 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GARSP41250 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GARSP41250 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GARSP41250 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GARSP41250 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GARSP41250 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GARSP41250 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GARSP41250 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GARSP41250 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GARSP41250 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GARSP41250 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GARSP41250 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GARSP41250 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GARSP41250 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GARSP41250 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GARSP41250 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GARSP41250 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GARSP41250 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GARSP41250 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GARSP41250 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GARSP41250 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GARSP41250 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GARSP41250 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GARSP41250 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GARSP41250 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GARSP41250 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GARSP41250 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GARSP41250 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GARSP41250 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GARSP41250 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GARSP41250 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GARSP41250 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GARSP41250 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GARSP41250 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GARSP41250 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GARSP41250 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GARSP41250 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GARSP41250 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GARSP41250 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GARSP41250 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GARSP41250 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
GARSP41250 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GARSP41250 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GARSP41250 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GARSP41250 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GARSP41250 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GARSP41250 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GARSP41250 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GARSP41250 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GARSP41250 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GARSP41250 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GARSP41250 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GARSP41250 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GARSP41250 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GARSP41250 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GARSP41250 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GARSP41250 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GARSP41250 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GARSP41250 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GARSP41250 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GARSP41250 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GARSP41250 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GARSP41250 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GARSP41250 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GARSP41250 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GARSP41250 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GARSP41250 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GARSP41250 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GARSP41250 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GARSP41250 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GARSP41250 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GARSP41250 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GARSP41250 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GARSP41250 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GARSP41250 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GARSP41250 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms