Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.92■■■■■ 4.3
KDM5CP41229 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
KDM5CP41229 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
KDM5CP41229 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
KDM5CP41229 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
KDM5CP41229 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
KDM5CP41229 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
KDM5CP41229 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
KDM5CP41229 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
KDM5CP41229 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
KDM5CP41229 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.3
KDM5CP41229 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM5CP41229 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM5CP41229 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM5CP41229 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
KDM5CP41229 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
KDM5CP41229 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
KDM5CP41229 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
KDM5CP41229 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
KDM5CP41229 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
KDM5CP41229 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
KDM5CP41229 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM5CP41229 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM5CP41229 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
KDM5CP41229 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
KDM5CP41229 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
KDM5CP41229 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
KDM5CP41229 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41.74■■■■■ 4.27
KDM5CP41229 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
KDM5CP41229 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
KDM5CP41229 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
KDM5CP41229 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
KDM5CP41229 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.67■■■■■ 4.26
KDM5CP41229 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
KDM5CP41229 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
KDM5CP41229 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.25
KDM5CP41229 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
KDM5CP41229 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
KDM5CP41229 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
KDM5CP41229 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
KDM5CP41229 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
KDM5CP41229 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
KDM5CP41229 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
KDM5CP41229 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
KDM5CP41229 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
KDM5CP41229 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
KDM5CP41229 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
KDM5CP41229 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
KDM5CP41229 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
KDM5CP41229 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.53■■■■■ 4.24
KDM5CP41229 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
KDM5CP41229 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
KDM5CP41229 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
KDM5CP41229 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
KDM5CP41229 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
KDM5CP41229 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
KDM5CP41229 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
KDM5CP41229 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
KDM5CP41229 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
KDM5CP41229 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC41.42■■■■■ 4.22
KDM5CP41229 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
KDM5CP41229 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
KDM5CP41229 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
KDM5CP41229 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
KDM5CP41229 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
KDM5CP41229 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
KDM5CP41229 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
KDM5CP41229 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
KDM5CP41229 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
KDM5CP41229 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
KDM5CP41229 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
KDM5CP41229 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
KDM5CP41229 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
KDM5CP41229 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
KDM5CP41229 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
KDM5CP41229 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
KDM5CP41229 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
KDM5CP41229 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
KDM5CP41229 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC41.29■■■■■ 4.2
KDM5CP41229 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
KDM5CP41229 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
KDM5CP41229 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
KDM5CP41229 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
KDM5CP41229 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
KDM5CP41229 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
KDM5CP41229 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
KDM5CP41229 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
KDM5CP41229 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
KDM5CP41229 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
KDM5CP41229 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.17■■■■■ 4.18
KDM5CP41229 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
KDM5CP41229 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
KDM5CP41229 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
KDM5CP41229 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
KDM5CP41229 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
KDM5CP41229 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
KDM5CP41229 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
KDM5CP41229 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
KDM5CP41229 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
KDM5CP41229 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms