Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
DDIT3P35638 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
DDIT3P35638 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
DDIT3P35638 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DDIT3P35638 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DDIT3P35638 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DDIT3P35638 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DDIT3P35638 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
DDIT3P35638 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
DDIT3P35638 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DDIT3P35638 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DDIT3P35638 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DDIT3P35638 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
DDIT3P35638 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
DDIT3P35638 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DDIT3P35638 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
DDIT3P35638 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DDIT3P35638 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DDIT3P35638 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
DDIT3P35638 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
DDIT3P35638 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
DDIT3P35638 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
DDIT3P35638 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
DDIT3P35638 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
DDIT3P35638 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DDIT3P35638 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DDIT3P35638 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
DDIT3P35638 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
DDIT3P35638 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
DDIT3P35638 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DDIT3P35638 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DDIT3P35638 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
DDIT3P35638 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DDIT3P35638 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
DDIT3P35638 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DDIT3P35638 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DDIT3P35638 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
DDIT3P35638 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
DDIT3P35638 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
DDIT3P35638 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
DDIT3P35638 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
DDIT3P35638 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
DDIT3P35638 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
DDIT3P35638 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
DDIT3P35638 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DDIT3P35638 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
DDIT3P35638 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
DDIT3P35638 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
DDIT3P35638 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
DDIT3P35638 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
DDIT3P35638 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
DDIT3P35638 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
DDIT3P35638 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
DDIT3P35638 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
DDIT3P35638 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
DDIT3P35638 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
DDIT3P35638 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
DDIT3P35638 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
DDIT3P35638 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
DDIT3P35638 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
DDIT3P35638 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
DDIT3P35638 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
DDIT3P35638 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
DDIT3P35638 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
DDIT3P35638 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
DDIT3P35638 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
DDIT3P35638 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDIT3P35638 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDIT3P35638 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDIT3P35638 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDIT3P35638 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDIT3P35638 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
DDIT3P35638 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
DDIT3P35638 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DDIT3P35638 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DDIT3P35638 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DDIT3P35638 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
DDIT3P35638 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
DDIT3P35638 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDIT3P35638 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDIT3P35638 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
DDIT3P35638 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
DDIT3P35638 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
DDIT3P35638 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
DDIT3P35638 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
DDIT3P35638 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
DDIT3P35638 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
DDIT3P35638 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDIT3P35638 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDIT3P35638 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDIT3P35638 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDIT3P35638 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDIT3P35638 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDIT3P35638 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
DDIT3P35638 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
DDIT3P35638 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
DDIT3P35638 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
DDIT3P35638 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
DDIT3P35638 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
DDIT3P35638 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms