Protein–RNA interactions for Protein: P30838

ALDH3A1, Aldehyde dehydrogenase, dimeric NADP-preferring, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH3A1P30838 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALDH3A1P30838 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALDH3A1P30838 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALDH3A1P30838 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALDH3A1P30838 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALDH3A1P30838 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALDH3A1P30838 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALDH3A1P30838 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALDH3A1P30838 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALDH3A1P30838 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALDH3A1P30838 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALDH3A1P30838 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALDH3A1P30838 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALDH3A1P30838 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALDH3A1P30838 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALDH3A1P30838 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ALDH3A1P30838 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALDH3A1P30838 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALDH3A1P30838 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH3A1P30838 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALDH3A1P30838 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALDH3A1P30838 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALDH3A1P30838 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALDH3A1P30838 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALDH3A1P30838 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALDH3A1P30838 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALDH3A1P30838 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALDH3A1P30838 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALDH3A1P30838 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALDH3A1P30838 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALDH3A1P30838 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALDH3A1P30838 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ALDH3A1P30838 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALDH3A1P30838 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALDH3A1P30838 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALDH3A1P30838 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALDH3A1P30838 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALDH3A1P30838 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALDH3A1P30838 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALDH3A1P30838 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALDH3A1P30838 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALDH3A1P30838 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALDH3A1P30838 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ALDH3A1P30838 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALDH3A1P30838 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALDH3A1P30838 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALDH3A1P30838 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALDH3A1P30838 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALDH3A1P30838 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALDH3A1P30838 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALDH3A1P30838 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALDH3A1P30838 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALDH3A1P30838 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALDH3A1P30838 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALDH3A1P30838 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALDH3A1P30838 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALDH3A1P30838 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALDH3A1P30838 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALDH3A1P30838 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALDH3A1P30838 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALDH3A1P30838 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALDH3A1P30838 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALDH3A1P30838 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALDH3A1P30838 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALDH3A1P30838 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALDH3A1P30838 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALDH3A1P30838 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALDH3A1P30838 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALDH3A1P30838 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALDH3A1P30838 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ALDH3A1P30838 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALDH3A1P30838 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALDH3A1P30838 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALDH3A1P30838 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALDH3A1P30838 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALDH3A1P30838 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALDH3A1P30838 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALDH3A1P30838 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALDH3A1P30838 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALDH3A1P30838 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALDH3A1P30838 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALDH3A1P30838 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALDH3A1P30838 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALDH3A1P30838 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALDH3A1P30838 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALDH3A1P30838 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ALDH3A1P30838 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALDH3A1P30838 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALDH3A1P30838 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALDH3A1P30838 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALDH3A1P30838 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALDH3A1P30838 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALDH3A1P30838 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALDH3A1P30838 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALDH3A1P30838 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALDH3A1P30838 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALDH3A1P30838 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ALDH3A1P30838 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ALDH3A1P30838 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALDH3A1P30838 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms