Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSPOP30536 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TSPOP30536 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSPOP30536 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSPOP30536 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSPOP30536 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSPOP30536 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSPOP30536 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSPOP30536 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSPOP30536 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSPOP30536 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSPOP30536 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSPOP30536 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSPOP30536 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSPOP30536 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSPOP30536 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSPOP30536 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSPOP30536 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TSPOP30536 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TSPOP30536 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSPOP30536 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TSPOP30536 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSPOP30536 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSPOP30536 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TSPOP30536 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPOP30536 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPOP30536 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPOP30536 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPOP30536 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPOP30536 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPOP30536 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSPOP30536 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSPOP30536 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSPOP30536 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSPOP30536 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSPOP30536 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSPOP30536 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPOP30536 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TSPOP30536 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TSPOP30536 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPOP30536 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPOP30536 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPOP30536 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPOP30536 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPOP30536 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPOP30536 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSPOP30536 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSPOP30536 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSPOP30536 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSPOP30536 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TSPOP30536 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPOP30536 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPOP30536 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPOP30536 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPOP30536 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPOP30536 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPOP30536 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPOP30536 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPOP30536 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPOP30536 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPOP30536 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPOP30536 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPOP30536 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPOP30536 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPOP30536 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPOP30536 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPOP30536 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPOP30536 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSPOP30536 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSPOP30536 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSPOP30536 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSPOP30536 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSPOP30536 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSPOP30536 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSPOP30536 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSPOP30536 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPOP30536 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPOP30536 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPOP30536 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPOP30536 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPOP30536 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPOP30536 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPOP30536 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPOP30536 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPOP30536 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPOP30536 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPOP30536 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPOP30536 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPOP30536 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPOP30536 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPOP30536 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPOP30536 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPOP30536 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPOP30536 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPOP30536 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPOP30536 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPOP30536 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPOP30536 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPOP30536 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPOP30536 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms