Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECHS1P30084 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECHS1P30084 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECHS1P30084 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECHS1P30084 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECHS1P30084 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECHS1P30084 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECHS1P30084 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECHS1P30084 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECHS1P30084 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECHS1P30084 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECHS1P30084 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECHS1P30084 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECHS1P30084 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECHS1P30084 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECHS1P30084 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECHS1P30084 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECHS1P30084 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECHS1P30084 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ECHS1P30084 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ECHS1P30084 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECHS1P30084 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECHS1P30084 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECHS1P30084 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECHS1P30084 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ECHS1P30084 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECHS1P30084 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECHS1P30084 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ECHS1P30084 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECHS1P30084 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECHS1P30084 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECHS1P30084 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECHS1P30084 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECHS1P30084 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECHS1P30084 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECHS1P30084 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECHS1P30084 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECHS1P30084 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECHS1P30084 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECHS1P30084 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECHS1P30084 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECHS1P30084 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECHS1P30084 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ECHS1P30084 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ECHS1P30084 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ECHS1P30084 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ECHS1P30084 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ECHS1P30084 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECHS1P30084 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ECHS1P30084 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ECHS1P30084 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ECHS1P30084 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ECHS1P30084 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ECHS1P30084 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECHS1P30084 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECHS1P30084 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECHS1P30084 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECHS1P30084 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ECHS1P30084 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ECHS1P30084 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ECHS1P30084 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ECHS1P30084 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ECHS1P30084 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ECHS1P30084 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ECHS1P30084 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECHS1P30084 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECHS1P30084 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECHS1P30084 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECHS1P30084 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECHS1P30084 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECHS1P30084 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECHS1P30084 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECHS1P30084 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ECHS1P30084 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ECHS1P30084 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ECHS1P30084 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ECHS1P30084 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ECHS1P30084 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ECHS1P30084 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ECHS1P30084 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECHS1P30084 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECHS1P30084 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECHS1P30084 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECHS1P30084 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECHS1P30084 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECHS1P30084 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ECHS1P30084 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ECHS1P30084 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECHS1P30084 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECHS1P30084 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECHS1P30084 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECHS1P30084 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECHS1P30084 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECHS1P30084 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ECHS1P30084 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ECHS1P30084 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ECHS1P30084 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ECHS1P30084 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ECHS1P30084 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ECHS1P30084 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms