Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTX3P26022 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTX3P26022 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTX3P26022 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTX3P26022 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTX3P26022 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTX3P26022 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTX3P26022 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTX3P26022 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTX3P26022 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTX3P26022 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTX3P26022 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTX3P26022 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTX3P26022 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTX3P26022 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTX3P26022 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTX3P26022 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTX3P26022 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTX3P26022 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTX3P26022 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTX3P26022 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTX3P26022 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTX3P26022 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTX3P26022 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTX3P26022 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTX3P26022 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTX3P26022 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTX3P26022 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTX3P26022 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTX3P26022 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTX3P26022 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTX3P26022 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTX3P26022 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTX3P26022 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTX3P26022 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTX3P26022 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTX3P26022 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTX3P26022 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTX3P26022 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTX3P26022 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTX3P26022 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTX3P26022 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTX3P26022 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTX3P26022 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTX3P26022 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTX3P26022 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTX3P26022 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTX3P26022 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTX3P26022 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTX3P26022 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTX3P26022 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTX3P26022 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTX3P26022 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTX3P26022 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTX3P26022 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTX3P26022 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTX3P26022 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTX3P26022 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTX3P26022 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTX3P26022 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTX3P26022 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTX3P26022 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTX3P26022 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTX3P26022 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTX3P26022 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTX3P26022 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTX3P26022 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTX3P26022 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTX3P26022 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTX3P26022 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTX3P26022 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTX3P26022 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTX3P26022 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTX3P26022 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTX3P26022 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTX3P26022 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTX3P26022 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTX3P26022 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTX3P26022 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTX3P26022 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTX3P26022 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTX3P26022 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTX3P26022 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTX3P26022 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTX3P26022 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTX3P26022 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTX3P26022 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTX3P26022 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTX3P26022 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTX3P26022 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTX3P26022 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTX3P26022 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTX3P26022 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTX3P26022 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTX3P26022 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTX3P26022 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTX3P26022 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTX3P26022 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTX3P26022 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTX3P26022 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms