Protein–RNA interactions for Protein: P25685

DNAJB1, DnaJ homolog subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB1P25685 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DNAJB1P25685 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DNAJB1P25685 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DNAJB1P25685 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNAJB1P25685 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNAJB1P25685 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
DNAJB1P25685 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DNAJB1P25685 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNAJB1P25685 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNAJB1P25685 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNAJB1P25685 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNAJB1P25685 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNAJB1P25685 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNAJB1P25685 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DNAJB1P25685 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNAJB1P25685 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNAJB1P25685 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNAJB1P25685 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
DNAJB1P25685 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNAJB1P25685 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNAJB1P25685 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNAJB1P25685 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNAJB1P25685 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNAJB1P25685 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DNAJB1P25685 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DNAJB1P25685 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DNAJB1P25685 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DNAJB1P25685 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DNAJB1P25685 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNAJB1P25685 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNAJB1P25685 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
DNAJB1P25685 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DNAJB1P25685 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DNAJB1P25685 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNAJB1P25685 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNAJB1P25685 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DNAJB1P25685 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNAJB1P25685 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DNAJB1P25685 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DNAJB1P25685 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DNAJB1P25685 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DNAJB1P25685 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DNAJB1P25685 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DNAJB1P25685 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DNAJB1P25685 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNAJB1P25685 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNAJB1P25685 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNAJB1P25685 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNAJB1P25685 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNAJB1P25685 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DNAJB1P25685 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DNAJB1P25685 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNAJB1P25685 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNAJB1P25685 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNAJB1P25685 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNAJB1P25685 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNAJB1P25685 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
DNAJB1P25685 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DNAJB1P25685 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DNAJB1P25685 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DNAJB1P25685 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DNAJB1P25685 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DNAJB1P25685 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DNAJB1P25685 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DNAJB1P25685 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DNAJB1P25685 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DNAJB1P25685 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DNAJB1P25685 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNAJB1P25685 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNAJB1P25685 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DNAJB1P25685 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DNAJB1P25685 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DNAJB1P25685 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
DNAJB1P25685 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNAJB1P25685 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNAJB1P25685 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNAJB1P25685 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DNAJB1P25685 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNAJB1P25685 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNAJB1P25685 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
DNAJB1P25685 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNAJB1P25685 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNAJB1P25685 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNAJB1P25685 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNAJB1P25685 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
DNAJB1P25685 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DNAJB1P25685 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DNAJB1P25685 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DNAJB1P25685 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DNAJB1P25685 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNAJB1P25685 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNAJB1P25685 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNAJB1P25685 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNAJB1P25685 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNAJB1P25685 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNAJB1P25685 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNAJB1P25685 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNAJB1P25685 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
DNAJB1P25685 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNAJB1P25685 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms