Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
S100A1P23297 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
S100A1P23297 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
S100A1P23297 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
S100A1P23297 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
S100A1P23297 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
S100A1P23297 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S100A1P23297 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S100A1P23297 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S100A1P23297 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S100A1P23297 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S100A1P23297 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S100A1P23297 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
S100A1P23297 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
S100A1P23297 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
S100A1P23297 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
S100A1P23297 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
S100A1P23297 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
S100A1P23297 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
S100A1P23297 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
S100A1P23297 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S100A1P23297 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S100A1P23297 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
S100A1P23297 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
S100A1P23297 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
S100A1P23297 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
S100A1P23297 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
S100A1P23297 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
S100A1P23297 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
S100A1P23297 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
S100A1P23297 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
S100A1P23297 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
S100A1P23297 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
S100A1P23297 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
S100A1P23297 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
S100A1P23297 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
S100A1P23297 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
S100A1P23297 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S100A1P23297 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S100A1P23297 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
S100A1P23297 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
S100A1P23297 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
S100A1P23297 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
S100A1P23297 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S100A1P23297 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S100A1P23297 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S100A1P23297 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
S100A1P23297 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
S100A1P23297 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
S100A1P23297 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
S100A1P23297 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
S100A1P23297 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
S100A1P23297 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
S100A1P23297 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
S100A1P23297 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
S100A1P23297 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
S100A1P23297 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
S100A1P23297 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
S100A1P23297 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
S100A1P23297 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
S100A1P23297 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
S100A1P23297 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
S100A1P23297 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
S100A1P23297 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
S100A1P23297 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
S100A1P23297 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
S100A1P23297 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
S100A1P23297 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
S100A1P23297 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
S100A1P23297 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
S100A1P23297 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
S100A1P23297 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
S100A1P23297 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
S100A1P23297 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
S100A1P23297 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
S100A1P23297 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
S100A1P23297 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
S100A1P23297 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
S100A1P23297 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
S100A1P23297 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S100A1P23297 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S100A1P23297 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S100A1P23297 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
S100A1P23297 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
S100A1P23297 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
S100A1P23297 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
S100A1P23297 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
S100A1P23297 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
S100A1P23297 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S100A1P23297 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
S100A1P23297 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
S100A1P23297 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
S100A1P23297 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
S100A1P23297 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
S100A1P23297 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
S100A1P23297 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
S100A1P23297 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
S100A1P23297 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
S100A1P23297 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
S100A1P23297 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms