Protein–RNA interactions for Protein: P23280

CA6, Carbonic anhydrase 6, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA6P23280 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA6P23280 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA6P23280 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA6P23280 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA6P23280 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA6P23280 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA6P23280 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA6P23280 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA6P23280 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA6P23280 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA6P23280 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA6P23280 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA6P23280 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA6P23280 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA6P23280 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA6P23280 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CA6P23280 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CA6P23280 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA6P23280 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA6P23280 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA6P23280 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA6P23280 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA6P23280 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA6P23280 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA6P23280 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CA6P23280 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA6P23280 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA6P23280 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA6P23280 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA6P23280 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA6P23280 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA6P23280 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CA6P23280 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA6P23280 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA6P23280 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA6P23280 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA6P23280 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CA6P23280 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CA6P23280 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA6P23280 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA6P23280 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA6P23280 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CA6P23280 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA6P23280 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA6P23280 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA6P23280 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CA6P23280 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA6P23280 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA6P23280 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA6P23280 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA6P23280 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA6P23280 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA6P23280 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CA6P23280 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CA6P23280 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA6P23280 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA6P23280 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA6P23280 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA6P23280 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA6P23280 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA6P23280 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA6P23280 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA6P23280 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CA6P23280 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CA6P23280 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CA6P23280 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CA6P23280 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CA6P23280 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CA6P23280 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CA6P23280 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CA6P23280 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CA6P23280 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CA6P23280 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CA6P23280 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CA6P23280 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA6P23280 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA6P23280 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA6P23280 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CA6P23280 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CA6P23280 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CA6P23280 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CA6P23280 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CA6P23280 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CA6P23280 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CA6P23280 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CA6P23280 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CA6P23280 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CA6P23280 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CA6P23280 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CA6P23280 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CA6P23280 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CA6P23280 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CA6P23280 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CA6P23280 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA6P23280 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA6P23280 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CA6P23280 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CA6P23280 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CA6P23280 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CA6P23280 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms