Protein–RNA interactions for Protein: P22105

TNXB, Tenascin-X, humanhuman

Predictions only

Length 4,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXBP22105 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXBP22105 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXBP22105 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNXBP22105 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNXBP22105 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNXBP22105 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNXBP22105 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNXBP22105 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXBP22105 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNXBP22105 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNXBP22105 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNXBP22105 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNXBP22105 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNXBP22105 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNXBP22105 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXBP22105 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXBP22105 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNXBP22105 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNXBP22105 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNXBP22105 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNXBP22105 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNXBP22105 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNXBP22105 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXBP22105 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXBP22105 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXBP22105 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXBP22105 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNXBP22105 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNXBP22105 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNXBP22105 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXBP22105 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXBP22105 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXBP22105 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXBP22105 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXBP22105 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXBP22105 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNXBP22105 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNXBP22105 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNXBP22105 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNXBP22105 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNXBP22105 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNXBP22105 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNXBP22105 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNXBP22105 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNXBP22105 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXBP22105 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXBP22105 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXBP22105 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXBP22105 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXBP22105 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXBP22105 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXBP22105 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXBP22105 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXBP22105 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNXBP22105 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNXBP22105 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNXBP22105 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXBP22105 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXBP22105 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TNXBP22105 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXBP22105 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXBP22105 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNXBP22105 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNXBP22105 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNXBP22105 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNXBP22105 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNXBP22105 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNXBP22105 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXBP22105 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXBP22105 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXBP22105 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXBP22105 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXBP22105 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNXBP22105 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXBP22105 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXBP22105 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXBP22105 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXBP22105 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXBP22105 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXBP22105 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXBP22105 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXBP22105 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXBP22105 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXBP22105 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXBP22105 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXBP22105 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXBP22105 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXBP22105 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXBP22105 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXBP22105 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXBP22105 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXBP22105 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXBP22105 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXBP22105 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXBP22105 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXBP22105 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
TNXBP22105 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXBP22105 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXBP22105 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXBP22105 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms