Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA5P20719 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA5P20719 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA5P20719 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA5P20719 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA5P20719 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA5P20719 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA5P20719 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA5P20719 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA5P20719 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA5P20719 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA5P20719 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA5P20719 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA5P20719 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA5P20719 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA5P20719 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA5P20719 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA5P20719 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA5P20719 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA5P20719 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA5P20719 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA5P20719 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA5P20719 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA5P20719 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA5P20719 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA5P20719 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA5P20719 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA5P20719 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA5P20719 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA5P20719 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA5P20719 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA5P20719 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA5P20719 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA5P20719 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA5P20719 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA5P20719 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA5P20719 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA5P20719 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA5P20719 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA5P20719 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXA5P20719 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXA5P20719 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXA5P20719 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA5P20719 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA5P20719 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA5P20719 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA5P20719 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA5P20719 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA5P20719 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA5P20719 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA5P20719 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA5P20719 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA5P20719 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA5P20719 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA5P20719 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA5P20719 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA5P20719 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA5P20719 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA5P20719 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA5P20719 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA5P20719 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA5P20719 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA5P20719 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA5P20719 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA5P20719 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA5P20719 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA5P20719 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA5P20719 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA5P20719 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA5P20719 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA5P20719 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA5P20719 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA5P20719 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA5P20719 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA5P20719 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA5P20719 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA5P20719 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXA5P20719 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXA5P20719 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms