Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HLA-DPA1P20036 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HLA-DPA1P20036 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HLA-DPA1P20036 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HLA-DPA1P20036 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HLA-DPA1P20036 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HLA-DPA1P20036 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HLA-DPA1P20036 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HLA-DPA1P20036 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HLA-DPA1P20036 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HLA-DPA1P20036 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HLA-DPA1P20036 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HLA-DPA1P20036 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HLA-DPA1P20036 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HLA-DPA1P20036 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HLA-DPA1P20036 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HLA-DPA1P20036 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HLA-DPA1P20036 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HLA-DPA1P20036 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HLA-DPA1P20036 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HLA-DPA1P20036 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HLA-DPA1P20036 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HLA-DPA1P20036 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HLA-DPA1P20036 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HLA-DPA1P20036 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HLA-DPA1P20036 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HLA-DPA1P20036 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HLA-DPA1P20036 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HLA-DPA1P20036 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HLA-DPA1P20036 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HLA-DPA1P20036 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HLA-DPA1P20036 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HLA-DPA1P20036 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HLA-DPA1P20036 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HLA-DPA1P20036 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HLA-DPA1P20036 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HLA-DPA1P20036 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLA-DPA1P20036 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HLA-DPA1P20036 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HLA-DPA1P20036 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HLA-DPA1P20036 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HLA-DPA1P20036 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HLA-DPA1P20036 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HLA-DPA1P20036 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HLA-DPA1P20036 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HLA-DPA1P20036 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HLA-DPA1P20036 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HLA-DPA1P20036 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HLA-DPA1P20036 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HLA-DPA1P20036 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HLA-DPA1P20036 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-DPA1P20036 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-DPA1P20036 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-DPA1P20036 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-DPA1P20036 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HLA-DPA1P20036 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HLA-DPA1P20036 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HLA-DPA1P20036 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HLA-DPA1P20036 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-DPA1P20036 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-DPA1P20036 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-DPA1P20036 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-DPA1P20036 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-DPA1P20036 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-DPA1P20036 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HLA-DPA1P20036 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HLA-DPA1P20036 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HLA-DPA1P20036 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HLA-DPA1P20036 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HLA-DPA1P20036 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HLA-DPA1P20036 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-DPA1P20036 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-DPA1P20036 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-DPA1P20036 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-DPA1P20036 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-DPA1P20036 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-DPA1P20036 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-DPA1P20036 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HLA-DPA1P20036 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HLA-DPA1P20036 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HLA-DPA1P20036 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HLA-DPA1P20036 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HLA-DPA1P20036 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HLA-DPA1P20036 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HLA-DPA1P20036 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HLA-DPA1P20036 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HLA-DPA1P20036 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HLA-DPA1P20036 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HLA-DPA1P20036 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HLA-DPA1P20036 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HLA-DPA1P20036 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HLA-DPA1P20036 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DPA1P20036 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DPA1P20036 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DPA1P20036 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HLA-DPA1P20036 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HLA-DPA1P20036 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DPA1P20036 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HLA-DPA1P20036 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HLA-DPA1P20036 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms