Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRAFP15056 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRAFP15056 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRAFP15056 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRAFP15056 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRAFP15056 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRAFP15056 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRAFP15056 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRAFP15056 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRAFP15056 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRAFP15056 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRAFP15056 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRAFP15056 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRAFP15056 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRAFP15056 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRAFP15056 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRAFP15056 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRAFP15056 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRAFP15056 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRAFP15056 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRAFP15056 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRAFP15056 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRAFP15056 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRAFP15056 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRAFP15056 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRAFP15056 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRAFP15056 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRAFP15056 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRAFP15056 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRAFP15056 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRAFP15056 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRAFP15056 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRAFP15056 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRAFP15056 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRAFP15056 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BRAFP15056 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
BRAFP15056 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRAFP15056 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRAFP15056 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRAFP15056 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BRAFP15056 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BRAFP15056 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRAFP15056 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRAFP15056 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRAFP15056 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRAFP15056 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRAFP15056 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRAFP15056 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRAFP15056 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRAFP15056 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRAFP15056 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRAFP15056 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRAFP15056 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRAFP15056 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRAFP15056 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRAFP15056 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRAFP15056 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRAFP15056 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRAFP15056 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRAFP15056 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRAFP15056 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
BRAFP15056 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRAFP15056 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRAFP15056 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRAFP15056 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRAFP15056 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRAFP15056 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRAFP15056 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRAFP15056 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRAFP15056 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRAFP15056 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRAFP15056 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRAFP15056 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRAFP15056 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRAFP15056 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRAFP15056 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRAFP15056 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRAFP15056 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRAFP15056 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRAFP15056 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRAFP15056 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRAFP15056 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRAFP15056 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRAFP15056 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRAFP15056 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRAFP15056 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRAFP15056 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRAFP15056 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRAFP15056 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRAFP15056 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
BRAFP15056 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRAFP15056 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRAFP15056 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRAFP15056 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRAFP15056 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRAFP15056 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRAFP15056 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRAFP15056 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRAFP15056 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRAFP15056 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms