Protein–RNA interactions for Protein: P14209

CD99, CD99 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99P14209 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD99P14209 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CD99P14209 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD99P14209 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD99P14209 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD99P14209 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD99P14209 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD99P14209 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD99P14209 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD99P14209 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD99P14209 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD99P14209 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD99P14209 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CD99P14209 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD99P14209 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD99P14209 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CD99P14209 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD99P14209 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD99P14209 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD99P14209 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD99P14209 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD99P14209 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD99P14209 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CD99P14209 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD99P14209 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD99P14209 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD99P14209 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD99P14209 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD99P14209 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD99P14209 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD99P14209 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD99P14209 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD99P14209 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD99P14209 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD99P14209 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD99P14209 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD99P14209 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD99P14209 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD99P14209 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD99P14209 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD99P14209 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD99P14209 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD99P14209 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD99P14209 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD99P14209 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD99P14209 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CD99P14209 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD99P14209 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD99P14209 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CD99P14209 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CD99P14209 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CD99P14209 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD99P14209 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD99P14209 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD99P14209 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD99P14209 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD99P14209 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD99P14209 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD99P14209 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD99P14209 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CD99P14209 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD99P14209 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD99P14209 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD99P14209 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD99P14209 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD99P14209 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD99P14209 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD99P14209 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD99P14209 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD99P14209 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD99P14209 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD99P14209 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD99P14209 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD99P14209 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD99P14209 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD99P14209 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD99P14209 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD99P14209 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD99P14209 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD99P14209 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD99P14209 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD99P14209 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD99P14209 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD99P14209 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD99P14209 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD99P14209 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD99P14209 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD99P14209 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD99P14209 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD99P14209 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD99P14209 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD99P14209 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD99P14209 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD99P14209 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD99P14209 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD99P14209 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CD99P14209 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CD99P14209 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CD99P14209 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD99P14209 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms