Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT13P13646 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT13P13646 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT13P13646 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT13P13646 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT13P13646 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KRT13P13646 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT13P13646 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT13P13646 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT13P13646 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT13P13646 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT13P13646 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT13P13646 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT13P13646 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT13P13646 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT13P13646 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT13P13646 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT13P13646 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT13P13646 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT13P13646 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT13P13646 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT13P13646 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT13P13646 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT13P13646 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT13P13646 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT13P13646 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT13P13646 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT13P13646 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT13P13646 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT13P13646 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT13P13646 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT13P13646 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KRT13P13646 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KRT13P13646 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KRT13P13646 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KRT13P13646 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KRT13P13646 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KRT13P13646 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KRT13P13646 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KRT13P13646 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KRT13P13646 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KRT13P13646 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KRT13P13646 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KRT13P13646 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KRT13P13646 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT13P13646 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT13P13646 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT13P13646 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT13P13646 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT13P13646 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT13P13646 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT13P13646 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT13P13646 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT13P13646 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT13P13646 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT13P13646 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT13P13646 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT13P13646 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT13P13646 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT13P13646 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT13P13646 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT13P13646 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT13P13646 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT13P13646 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT13P13646 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT13P13646 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT13P13646 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT13P13646 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT13P13646 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT13P13646 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT13P13646 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT13P13646 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT13P13646 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT13P13646 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT13P13646 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT13P13646 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT13P13646 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT13P13646 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT13P13646 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT13P13646 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT13P13646 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT13P13646 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT13P13646 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT13P13646 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT13P13646 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT13P13646 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT13P13646 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT13P13646 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT13P13646 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT13P13646 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT13P13646 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT13P13646 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT13P13646 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT13P13646 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT13P13646 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT13P13646 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT13P13646 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT13P13646 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT13P13646 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT13P13646 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms