Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ATP1A3P13637 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP1A3P13637 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP1A3P13637 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP1A3P13637 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP1A3P13637 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP1A3P13637 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP1A3P13637 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP1A3P13637 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP1A3P13637 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP1A3P13637 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP1A3P13637 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP1A3P13637 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP1A3P13637 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP1A3P13637 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP1A3P13637 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP1A3P13637 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP1A3P13637 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP1A3P13637 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP1A3P13637 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP1A3P13637 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP1A3P13637 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP1A3P13637 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP1A3P13637 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP1A3P13637 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP1A3P13637 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP1A3P13637 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP1A3P13637 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP1A3P13637 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP1A3P13637 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP1A3P13637 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP1A3P13637 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP1A3P13637 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP1A3P13637 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP1A3P13637 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP1A3P13637 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP1A3P13637 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP1A3P13637 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP1A3P13637 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP1A3P13637 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP1A3P13637 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP1A3P13637 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP1A3P13637 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP1A3P13637 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP1A3P13637 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP1A3P13637 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP1A3P13637 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
ATP1A3P13637 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP1A3P13637 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP1A3P13637 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP1A3P13637 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP1A3P13637 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP1A3P13637 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP1A3P13637 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP1A3P13637 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP1A3P13637 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP1A3P13637 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP1A3P13637 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP1A3P13637 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP1A3P13637 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP1A3P13637 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP1A3P13637 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP1A3P13637 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP1A3P13637 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP1A3P13637 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP1A3P13637 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP1A3P13637 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP1A3P13637 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP1A3P13637 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP1A3P13637 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP1A3P13637 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP1A3P13637 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP1A3P13637 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ATP1A3P13637 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP1A3P13637 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP1A3P13637 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP1A3P13637 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP1A3P13637 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP1A3P13637 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP1A3P13637 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP1A3P13637 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP1A3P13637 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP1A3P13637 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP1A3P13637 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP1A3P13637 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP1A3P13637 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP1A3P13637 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP1A3P13637 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP1A3P13637 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP1A3P13637 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP1A3P13637 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP1A3P13637 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP1A3P13637 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP1A3P13637 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP1A3P13637 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP1A3P13637 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP1A3P13637 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP1A3P13637 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP1A3P13637 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP1A3P13637 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms