Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CKBP12277 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CKBP12277 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CKBP12277 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CKBP12277 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CKBP12277 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CKBP12277 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CKBP12277 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CKBP12277 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CKBP12277 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CKBP12277 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CKBP12277 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CKBP12277 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CKBP12277 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CKBP12277 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CKBP12277 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CKBP12277 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CKBP12277 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CKBP12277 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CKBP12277 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CKBP12277 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CKBP12277 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CKBP12277 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CKBP12277 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CKBP12277 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CKBP12277 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CKBP12277 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CKBP12277 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CKBP12277 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CKBP12277 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CKBP12277 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CKBP12277 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CKBP12277 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CKBP12277 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CKBP12277 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CKBP12277 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CKBP12277 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CKBP12277 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CKBP12277 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CKBP12277 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CKBP12277 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CKBP12277 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CKBP12277 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CKBP12277 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CKBP12277 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CKBP12277 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CKBP12277 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CKBP12277 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CKBP12277 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CKBP12277 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CKBP12277 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CKBP12277 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CKBP12277 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CKBP12277 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CKBP12277 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CKBP12277 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CKBP12277 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CKBP12277 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CKBP12277 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CKBP12277 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CKBP12277 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CKBP12277 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CKBP12277 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CKBP12277 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CKBP12277 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CKBP12277 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CKBP12277 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CKBP12277 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CKBP12277 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CKBP12277 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CKBP12277 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CKBP12277 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CKBP12277 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CKBP12277 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CKBP12277 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CKBP12277 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CKBP12277 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CKBP12277 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CKBP12277 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CKBP12277 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CKBP12277 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CKBP12277 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CKBP12277 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CKBP12277 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CKBP12277 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CKBP12277 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CKBP12277 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CKBP12277 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CKBP12277 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CKBP12277 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CKBP12277 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CKBP12277 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CKBP12277 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CKBP12277 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CKBP12277 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CKBP12277 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CKBP12277 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CKBP12277 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CKBP12277 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CKBP12277 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms