Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL6A2P12110 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL6A2P12110 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL6A2P12110 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL6A2P12110 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL6A2P12110 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL6A2P12110 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL6A2P12110 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL6A2P12110 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL6A2P12110 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL6A2P12110 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL6A2P12110 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL6A2P12110 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL6A2P12110 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL6A2P12110 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL6A2P12110 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL6A2P12110 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL6A2P12110 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL6A2P12110 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL6A2P12110 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL6A2P12110 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL6A2P12110 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL6A2P12110 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL6A2P12110 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL6A2P12110 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL6A2P12110 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COL6A2P12110 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
COL6A2P12110 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
COL6A2P12110 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
COL6A2P12110 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL6A2P12110 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL6A2P12110 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL6A2P12110 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL6A2P12110 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL6A2P12110 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL6A2P12110 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL6A2P12110 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL6A2P12110 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL6A2P12110 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL6A2P12110 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL6A2P12110 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL6A2P12110 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL6A2P12110 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL6A2P12110 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL6A2P12110 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL6A2P12110 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL6A2P12110 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL6A2P12110 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL6A2P12110 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL6A2P12110 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
COL6A2P12110 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL6A2P12110 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL6A2P12110 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL6A2P12110 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL6A2P12110 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL6A2P12110 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL6A2P12110 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL6A2P12110 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
COL6A2P12110 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL6A2P12110 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL6A2P12110 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL6A2P12110 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL6A2P12110 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
COL6A2P12110 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL6A2P12110 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL6A2P12110 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL6A2P12110 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL6A2P12110 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL6A2P12110 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL6A2P12110 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL6A2P12110 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL6A2P12110 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL6A2P12110 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL6A2P12110 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL6A2P12110 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL6A2P12110 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL6A2P12110 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
COL6A2P12110 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL6A2P12110 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL6A2P12110 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL6A2P12110 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL6A2P12110 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL6A2P12110 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL6A2P12110 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL6A2P12110 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL6A2P12110 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL6A2P12110 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL6A2P12110 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL6A2P12110 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL6A2P12110 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL6A2P12110 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL6A2P12110 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL6A2P12110 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL6A2P12110 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL6A2P12110 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL6A2P12110 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL6A2P12110 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL6A2P12110 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL6A2P12110 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
COL6A2P12110 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms